Protein–RNA interactions for Protein: P57791

Rce1, CAAX prenyl protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rce1P57791 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rce1P57791 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rce1P57791 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rce1P57791 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rce1P57791 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rce1P57791 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rce1P57791 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rce1P57791 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rce1P57791 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rce1P57791 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rce1P57791 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rce1P57791 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rce1P57791 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rce1P57791 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rce1P57791 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rce1P57791 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rce1P57791 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rce1P57791 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rce1P57791 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rce1P57791 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rce1P57791 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rce1P57791 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rce1P57791 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rce1P57791 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rce1P57791 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rce1P57791 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rce1P57791 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rce1P57791 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rce1P57791 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rce1P57791 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rce1P57791 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rce1P57791 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rce1P57791 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rce1P57791 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rce1P57791 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rce1P57791 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rce1P57791 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rce1P57791 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rce1P57791 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rce1P57791 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rce1P57791 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rce1P57791 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rce1P57791 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rce1P57791 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rce1P57791 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rce1P57791 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rce1P57791 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rce1P57791 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rce1P57791 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rce1P57791 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rce1P57791 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rce1P57791 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rce1P57791 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rce1P57791 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rce1P57791 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rce1P57791 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rce1P57791 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rce1P57791 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rce1P57791 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rce1P57791 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rce1P57791 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rce1P57791 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rce1P57791 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rce1P57791 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rce1P57791 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rce1P57791 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rce1P57791 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rce1P57791 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rce1P57791 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rce1P57791 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rce1P57791 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rce1P57791 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rce1P57791 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rce1P57791 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rce1P57791 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rce1P57791 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rce1P57791 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rce1P57791 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rce1P57791 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rce1P57791 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rce1P57791 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rce1P57791 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rce1P57791 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rce1P57791 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rce1P57791 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rce1P57791 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rce1P57791 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rce1P57791 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rce1P57791 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rce1P57791 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rce1P57791 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rce1P57791 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rce1P57791 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rce1P57791 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rce1P57791 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rce1P57791 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rce1P57791 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rce1P57791 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rce1P57791 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rce1P57791 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms