Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GferP56213 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GferP56213 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GferP56213 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GferP56213 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GferP56213 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GferP56213 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GferP56213 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GferP56213 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GferP56213 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GferP56213 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GferP56213 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GferP56213 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GferP56213 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GferP56213 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GferP56213 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GferP56213 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GferP56213 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GferP56213 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GferP56213 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GferP56213 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GferP56213 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GferP56213 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GferP56213 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GferP56213 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GferP56213 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GferP56213 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GferP56213 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GferP56213 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GferP56213 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GferP56213 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GferP56213 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GferP56213 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GferP56213 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GferP56213 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GferP56213 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GferP56213 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GferP56213 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GferP56213 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GferP56213 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GferP56213 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
GferP56213 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GferP56213 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GferP56213 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GferP56213 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GferP56213 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GferP56213 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GferP56213 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GferP56213 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GferP56213 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GferP56213 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GferP56213 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GferP56213 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GferP56213 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GferP56213 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GferP56213 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GferP56213 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GferP56213 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GferP56213 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GferP56213 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GferP56213 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GferP56213 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GferP56213 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GferP56213 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GferP56213 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GferP56213 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GferP56213 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GferP56213 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GferP56213 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GferP56213 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GferP56213 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GferP56213 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GferP56213 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GferP56213 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GferP56213 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GferP56213 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GferP56213 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GferP56213 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GferP56213 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GferP56213 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GferP56213 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GferP56213 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GferP56213 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GferP56213 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GferP56213 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GferP56213 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GferP56213 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
GferP56213 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GferP56213 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GferP56213 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GferP56213 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GferP56213 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GferP56213 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GferP56213 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GferP56213 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GferP56213 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
GferP56213 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
GferP56213 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GferP56213 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GferP56213 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms