Protein–RNA interactions for Protein: P51942

Matn1, Cartilage matrix protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Matn1P51942 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Matn1P51942 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Matn1P51942 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Matn1P51942 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Matn1P51942 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Matn1P51942 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Matn1P51942 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Matn1P51942 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Matn1P51942 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Matn1P51942 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Matn1P51942 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Matn1P51942 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Matn1P51942 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Matn1P51942 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Matn1P51942 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Matn1P51942 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Matn1P51942 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Matn1P51942 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Matn1P51942 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Matn1P51942 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Matn1P51942 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Matn1P51942 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Matn1P51942 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Matn1P51942 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Matn1P51942 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Matn1P51942 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Matn1P51942 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Matn1P51942 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Matn1P51942 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Matn1P51942 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Matn1P51942 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Matn1P51942 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Matn1P51942 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Matn1P51942 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Matn1P51942 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Matn1P51942 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Matn1P51942 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Matn1P51942 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Matn1P51942 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Matn1P51942 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Matn1P51942 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Matn1P51942 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Matn1P51942 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Matn1P51942 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Matn1P51942 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Matn1P51942 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Matn1P51942 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Matn1P51942 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Matn1P51942 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Matn1P51942 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Matn1P51942 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Matn1P51942 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Matn1P51942 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Matn1P51942 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Matn1P51942 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Matn1P51942 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Matn1P51942 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Matn1P51942 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Matn1P51942 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Matn1P51942 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Matn1P51942 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Matn1P51942 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Matn1P51942 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Matn1P51942 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Matn1P51942 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Matn1P51942 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Matn1P51942 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Matn1P51942 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Matn1P51942 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Matn1P51942 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Matn1P51942 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Matn1P51942 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Matn1P51942 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Matn1P51942 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Matn1P51942 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Matn1P51942 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Matn1P51942 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Matn1P51942 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Matn1P51942 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Matn1P51942 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Matn1P51942 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Matn1P51942 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Matn1P51942 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Matn1P51942 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Matn1P51942 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Matn1P51942 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Matn1P51942 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Matn1P51942 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Matn1P51942 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Matn1P51942 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Matn1P51942 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Matn1P51942 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Matn1P51942 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Matn1P51942 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Matn1P51942 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Matn1P51942 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Matn1P51942 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Matn1P51942 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Matn1P51942 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Matn1P51942 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms