Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CitP49025 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CitP49025 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CitP49025 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CitP49025 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CitP49025 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CitP49025 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CitP49025 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CitP49025 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CitP49025 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CitP49025 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CitP49025 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CitP49025 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CitP49025 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CitP49025 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CitP49025 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CitP49025 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CitP49025 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CitP49025 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CitP49025 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CitP49025 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CitP49025 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CitP49025 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CitP49025 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CitP49025 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CitP49025 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CitP49025 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CitP49025 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CitP49025 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CitP49025 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CitP49025 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CitP49025 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CitP49025 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CitP49025 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CitP49025 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CitP49025 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CitP49025 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CitP49025 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CitP49025 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CitP49025 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CitP49025 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CitP49025 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CitP49025 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
CitP49025 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CitP49025 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CitP49025 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CitP49025 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CitP49025 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CitP49025 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CitP49025 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CitP49025 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CitP49025 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CitP49025 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CitP49025 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CitP49025 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CitP49025 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CitP49025 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CitP49025 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CitP49025 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CitP49025 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CitP49025 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CitP49025 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CitP49025 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CitP49025 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CitP49025 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CitP49025 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CitP49025 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CitP49025 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CitP49025 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CitP49025 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CitP49025 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CitP49025 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
CitP49025 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CitP49025 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CitP49025 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CitP49025 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CitP49025 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CitP49025 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CitP49025 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CitP49025 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CitP49025 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CitP49025 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CitP49025 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CitP49025 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CitP49025 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CitP49025 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CitP49025 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CitP49025 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CitP49025 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CitP49025 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CitP49025 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CitP49025 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CitP49025 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CitP49025 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CitP49025 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CitP49025 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CitP49025 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CitP49025 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CitP49025 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CitP49025 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms