Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rfx2P48379 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rfx2P48379 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rfx2P48379 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rfx2P48379 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rfx2P48379 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rfx2P48379 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rfx2P48379 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rfx2P48379 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rfx2P48379 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rfx2P48379 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Rfx2P48379 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rfx2P48379 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rfx2P48379 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rfx2P48379 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rfx2P48379 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rfx2P48379 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Rfx2P48379 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rfx2P48379 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rfx2P48379 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rfx2P48379 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rfx2P48379 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rfx2P48379 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Rfx2P48379 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rfx2P48379 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rfx2P48379 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rfx2P48379 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Rfx2P48379 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rfx2P48379 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rfx2P48379 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rfx2P48379 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rfx2P48379 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rfx2P48379 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rfx2P48379 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rfx2P48379 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rfx2P48379 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rfx2P48379 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rfx2P48379 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rfx2P48379 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rfx2P48379 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rfx2P48379 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rfx2P48379 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rfx2P48379 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rfx2P48379 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Rfx2P48379 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rfx2P48379 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rfx2P48379 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rfx2P48379 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rfx2P48379 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rfx2P48379 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rfx2P48379 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rfx2P48379 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rfx2P48379 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rfx2P48379 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Rfx2P48379 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rfx2P48379 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Rfx2P48379 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rfx2P48379 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Rfx2P48379 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rfx2P48379 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rfx2P48379 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rfx2P48379 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rfx2P48379 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rfx2P48379 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Rfx2P48379 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rfx2P48379 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rfx2P48379 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rfx2P48379 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rfx2P48379 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rfx2P48379 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rfx2P48379 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rfx2P48379 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rfx2P48379 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rfx2P48379 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rfx2P48379 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rfx2P48379 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rfx2P48379 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rfx2P48379 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rfx2P48379 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rfx2P48379 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rfx2P48379 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rfx2P48379 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rfx2P48379 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rfx2P48379 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rfx2P48379 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rfx2P48379 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Rfx2P48379 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Rfx2P48379 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rfx2P48379 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Rfx2P48379 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rfx2P48379 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rfx2P48379 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rfx2P48379 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rfx2P48379 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rfx2P48379 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rfx2P48379 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rfx2P48379 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rfx2P48379 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rfx2P48379 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rfx2P48379 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms