Protein–RNA interactions for Protein: P47856

Gfpt1, Glutamine--fructose-6-phosphate aminotransferase [isomerizing] 1, mousemouse

Predictions only

Length 697 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfpt1P47856 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Gfpt1P47856 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29,11■■■□□ 2,25
Gfpt1P47856 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Gfpt1P47856 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Gfpt1P47856 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29,08■■■□□ 2,25
Gfpt1P47856 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Gfpt1P47856 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29,06■■■□□ 2,24
Gfpt1P47856 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Gfpt1P47856 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Gfpt1P47856 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29,04■■■□□ 2,24
Gfpt1P47856 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,03■■■□□ 2,24
Gfpt1P47856 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Gfpt1P47856 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Gfpt1P47856 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28,97■■■□□ 2,23
Gfpt1P47856 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Gfpt1P47856 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28,96■■■□□ 2,23
Gfpt1P47856 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Gfpt1P47856 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Gfpt1P47856 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Gfpt1P47856 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28,92■■■□□ 2,22
Gfpt1P47856 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Gfpt1P47856 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,92■■■□□ 2,22
Gfpt1P47856 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28,88■■■□□ 2,21
Gfpt1P47856 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Gfpt1P47856 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Gfpt1P47856 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Gfpt1P47856 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28,85■■■□□ 2,21
Gfpt1P47856 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Gfpt1P47856 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Gfpt1P47856 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28,83■■■□□ 2,21
Gfpt1P47856 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28,8■■■□□ 2,2
Gfpt1P47856 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Gfpt1P47856 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Gfpt1P47856 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Gfpt1P47856 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28,76■■■□□ 2,19
Gfpt1P47856 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Gfpt1P47856 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28,76■■■□□ 2,19
Gfpt1P47856 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Gfpt1P47856 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28,7■■■□□ 2,18
Gfpt1P47856 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Gfpt1P47856 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Gfpt1P47856 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28,68■■■□□ 2,18
Gfpt1P47856 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28,67■■■□□ 2,18
Gfpt1P47856 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28,67■■■□□ 2,18
Gfpt1P47856 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Gfpt1P47856 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Gfpt1P47856 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28,66■■■□□ 2,18
Gfpt1P47856 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28,66■■■□□ 2,18
Gfpt1P47856 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Gfpt1P47856 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,17
Gfpt1P47856 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28,63■■■□□ 2,17
Gfpt1P47856 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Gfpt1P47856 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Gfpt1P47856 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,61■■■□□ 2,17
Gfpt1P47856 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Gfpt1P47856 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Gfpt1P47856 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28,57■■■□□ 2,16
Gfpt1P47856 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28,55■■■□□ 2,16
Gfpt1P47856 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Gfpt1P47856 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Gfpt1P47856 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28,49■■■□□ 2,15
Gfpt1P47856 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Gfpt1P47856 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,46■■■□□ 2,15
Gfpt1P47856 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Gfpt1P47856 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28,44■■■□□ 2,14
Gfpt1P47856 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28,44■■■□□ 2,14
Gfpt1P47856 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Gfpt1P47856 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Gfpt1P47856 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Gfpt1P47856 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Gfpt1P47856 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28,4■■■□□ 2,14
Gfpt1P47856 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28,38■■■□□ 2,13
Gfpt1P47856 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Gfpt1P47856 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Gfpt1P47856 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Gfpt1P47856 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Gfpt1P47856 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28,36■■■□□ 2,13
Gfpt1P47856 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Gfpt1P47856 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Gfpt1P47856 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Gfpt1P47856 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Gfpt1P47856 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28,28■■■□□ 2,12
Gfpt1P47856 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Gfpt1P47856 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Gfpt1P47856 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Gfpt1P47856 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Gfpt1P47856 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Gfpt1P47856 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,25■■■□□ 2,11
Gfpt1P47856 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,25■■■□□ 2,11
Gfpt1P47856 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Gfpt1P47856 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Gfpt1P47856 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Gfpt1P47856 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Gfpt1P47856 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Gfpt1P47856 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Gfpt1P47856 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28,2■■■□□ 2,1
Gfpt1P47856 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28,19■■■□□ 2,1
Gfpt1P47856 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Gfpt1P47856 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Gfpt1P47856 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27,5 ms