Protein–RNA interactions for Protein: P42932

Cct8, T-complex protein 1 subunit theta, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct8P42932 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cct8P42932 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cct8P42932 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cct8P42932 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cct8P42932 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cct8P42932 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cct8P42932 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cct8P42932 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cct8P42932 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Cct8P42932 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cct8P42932 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cct8P42932 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cct8P42932 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Cct8P42932 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cct8P42932 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cct8P42932 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Cct8P42932 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cct8P42932 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cct8P42932 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cct8P42932 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cct8P42932 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cct8P42932 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cct8P42932 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cct8P42932 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cct8P42932 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cct8P42932 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cct8P42932 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Cct8P42932 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cct8P42932 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Cct8P42932 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cct8P42932 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cct8P42932 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cct8P42932 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cct8P42932 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cct8P42932 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cct8P42932 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cct8P42932 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cct8P42932 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cct8P42932 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Cct8P42932 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cct8P42932 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cct8P42932 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cct8P42932 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cct8P42932 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Cct8P42932 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Cct8P42932 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cct8P42932 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cct8P42932 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cct8P42932 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cct8P42932 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cct8P42932 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cct8P42932 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cct8P42932 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cct8P42932 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cct8P42932 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cct8P42932 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cct8P42932 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cct8P42932 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Cct8P42932 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cct8P42932 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cct8P42932 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cct8P42932 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cct8P42932 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cct8P42932 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cct8P42932 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cct8P42932 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cct8P42932 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cct8P42932 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cct8P42932 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cct8P42932 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cct8P42932 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cct8P42932 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cct8P42932 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Cct8P42932 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cct8P42932 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cct8P42932 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cct8P42932 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cct8P42932 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cct8P42932 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cct8P42932 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cct8P42932 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cct8P42932 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cct8P42932 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cct8P42932 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cct8P42932 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cct8P42932 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cct8P42932 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cct8P42932 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cct8P42932 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cct8P42932 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cct8P42932 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cct8P42932 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Cct8P42932 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cct8P42932 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cct8P42932 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cct8P42932 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cct8P42932 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cct8P42932 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cct8P42932 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cct8P42932 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms