Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VhlP40338 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VhlP40338 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VhlP40338 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VhlP40338 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VhlP40338 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VhlP40338 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VhlP40338 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VhlP40338 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VhlP40338 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VhlP40338 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VhlP40338 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VhlP40338 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VhlP40338 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VhlP40338 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VhlP40338 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VhlP40338 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VhlP40338 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VhlP40338 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VhlP40338 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VhlP40338 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
VhlP40338 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VhlP40338 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VhlP40338 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VhlP40338 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VhlP40338 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VhlP40338 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
VhlP40338 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VhlP40338 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VhlP40338 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VhlP40338 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
VhlP40338 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VhlP40338 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VhlP40338 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VhlP40338 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VhlP40338 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VhlP40338 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VhlP40338 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VhlP40338 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VhlP40338 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VhlP40338 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VhlP40338 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VhlP40338 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
VhlP40338 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VhlP40338 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VhlP40338 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VhlP40338 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VhlP40338 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VhlP40338 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VhlP40338 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VhlP40338 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VhlP40338 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VhlP40338 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VhlP40338 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VhlP40338 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
VhlP40338 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VhlP40338 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VhlP40338 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
VhlP40338 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VhlP40338 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VhlP40338 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VhlP40338 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VhlP40338 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VhlP40338 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VhlP40338 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VhlP40338 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VhlP40338 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VhlP40338 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VhlP40338 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VhlP40338 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VhlP40338 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VhlP40338 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VhlP40338 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VhlP40338 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VhlP40338 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VhlP40338 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VhlP40338 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VhlP40338 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VhlP40338 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VhlP40338 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VhlP40338 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
VhlP40338 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VhlP40338 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VhlP40338 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VhlP40338 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VhlP40338 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VhlP40338 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VhlP40338 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VhlP40338 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VhlP40338 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VhlP40338 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VhlP40338 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
VhlP40338 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VhlP40338 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VhlP40338 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
VhlP40338 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VhlP40338 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VhlP40338 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VhlP40338 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VhlP40338 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms