Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,35■■■■□ 3,41
Cnga1P29974 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC36,35■■■■□ 3,41
Cnga1P29974 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC36,34■■■■□ 3,41
Cnga1P29974 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC36,33■■■■□ 3,41
Cnga1P29974 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,31■■■■□ 3,4
Cnga1P29974 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36,31■■■■□ 3,4
Cnga1P29974 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,28■■■■□ 3,4
Cnga1P29974 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC36,27■■■■□ 3,4
Cnga1P29974 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC36,27■■■■□ 3,4
Cnga1P29974 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,25■■■■□ 3,39
Cnga1P29974 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC36,24■■■■□ 3,39
Cnga1P29974 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,23■■■■□ 3,39
Cnga1P29974 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,23■■■■□ 3,39
Cnga1P29974 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,22■■■■□ 3,39
Cnga1P29974 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,19■■■■□ 3,38
Cnga1P29974 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC36,19■■■■□ 3,38
Cnga1P29974 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,17■■■■□ 3,38
Cnga1P29974 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC36,15■■■■□ 3,38
Cnga1P29974 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC36,13■■■■□ 3,37
Cnga1P29974 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC36,12■■■■□ 3,37
Cnga1P29974 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,11■■■■□ 3,37
Cnga1P29974 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36,1■■■■□ 3,37
Cnga1P29974 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,05■■■■□ 3,36
Cnga1P29974 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC36,05■■■■□ 3,36
Cnga1P29974 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC36,02■■■■□ 3,36
Cnga1P29974 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,01■■■■□ 3,36
Cnga1P29974 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,99■■■■□ 3,35
Cnga1P29974 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC35,99■■■■□ 3,35
Cnga1P29974 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,98■■■■□ 3,35
Cnga1P29974 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,96■■■■□ 3,35
Cnga1P29974 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,93■■■■□ 3,34
Cnga1P29974 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,91■■■■□ 3,34
Cnga1P29974 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC35,9■■■■□ 3,34
Cnga1P29974 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC35,9■■■■□ 3,34
Cnga1P29974 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,89■■■■□ 3,34
Cnga1P29974 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC35,85■■■■□ 3,33
Cnga1P29974 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC35,83■■■■□ 3,33
Cnga1P29974 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,83■■■■□ 3,33
Cnga1P29974 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC35,82■■■■□ 3,33
Cnga1P29974 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC35,82■■■■□ 3,32
Cnga1P29974 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,79■■■■□ 3,32
Cnga1P29974 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,78■■■■□ 3,32
Cnga1P29974 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC35,76■■■■□ 3,32
Cnga1P29974 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC35,76■■■■□ 3,31
Cnga1P29974 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,76■■■■□ 3,31
Cnga1P29974 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC35,75■■■■□ 3,31
Cnga1P29974 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC35,74■■■■□ 3,31
Cnga1P29974 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC35,71■■■■□ 3,31
Cnga1P29974 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,7■■■■□ 3,31
Cnga1P29974 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,68■■■■□ 3,3
Cnga1P29974 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC35,67■■■■□ 3,3
Cnga1P29974 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,67■■■■□ 3,3
Cnga1P29974 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,66■■■■□ 3,3
Cnga1P29974 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,63■■■■□ 3,29
Cnga1P29974 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,62■■■■□ 3,29
Cnga1P29974 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,6■■■■□ 3,29
Cnga1P29974 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC35,6■■■■□ 3,29
Cnga1P29974 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,59■■■■□ 3,29
Cnga1P29974 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,57■■■■□ 3,28
Cnga1P29974 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,56■■■■□ 3,28
Cnga1P29974 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC35,55■■■■□ 3,28
Cnga1P29974 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,53■■■■□ 3,28
Cnga1P29974 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC35,53■■■■□ 3,28
Cnga1P29974 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35,52■■■■□ 3,28
Cnga1P29974 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC35,52■■■■□ 3,28
Cnga1P29974 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC35,51■■■■□ 3,28
Cnga1P29974 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,49■■■■□ 3,27
Cnga1P29974 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,48■■■■□ 3,27
Cnga1P29974 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,47■■■■□ 3,27
Cnga1P29974 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,47■■■■□ 3,27
Cnga1P29974 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,41■■■■□ 3,26
Cnga1P29974 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC35,4■■■■□ 3,26
Cnga1P29974 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,39■■■■□ 3,26
Cnga1P29974 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC35,39■■■■□ 3,26
Cnga1P29974 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC35,35■■■■□ 3,25
Cnga1P29974 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,34■■■■□ 3,25
Cnga1P29974 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,33■■■■□ 3,25
Cnga1P29974 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC35,33■■■■□ 3,25
Cnga1P29974 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,31■■■■□ 3,24
Cnga1P29974 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC35,31■■■■□ 3,24
Cnga1P29974 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,3■■■■□ 3,24
Cnga1P29974 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC35,29■■■■□ 3,24
Cnga1P29974 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,28■■■■□ 3,24
Cnga1P29974 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC35,28■■■■□ 3,24
Cnga1P29974 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,28■■■■□ 3,24
Cnga1P29974 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,28■■■■□ 3,24
Cnga1P29974 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,28■■■■□ 3,24
Cnga1P29974 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35,27■■■■□ 3,24
Cnga1P29974 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35,26■■■■□ 3,24
Cnga1P29974 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,26■■■■□ 3,24
Cnga1P29974 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,25■■■■□ 3,23
Cnga1P29974 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC35,25■■■■□ 3,23
Cnga1P29974 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC35,25■■■■□ 3,23
Cnga1P29974 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,24■■■■□ 3,23
Cnga1P29974 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC35,21■■■■□ 3,23
Cnga1P29974 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,2■■■■□ 3,23
Cnga1P29974 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC35,2■■■■□ 3,23
Cnga1P29974 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC35,2■■■■□ 3,22
Cnga1P29974 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC35,19■■■■□ 3,22
Cnga1P29974 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,18■■■■□ 3,22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms