Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccnd1P25322 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccnd1P25322 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccnd1P25322 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccnd1P25322 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccnd1P25322 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccnd1P25322 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccnd1P25322 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccnd1P25322 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccnd1P25322 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccnd1P25322 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccnd1P25322 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccnd1P25322 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccnd1P25322 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccnd1P25322 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccnd1P25322 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccnd1P25322 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccnd1P25322 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccnd1P25322 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccnd1P25322 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccnd1P25322 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccnd1P25322 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccnd1P25322 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccnd1P25322 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccnd1P25322 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccnd1P25322 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccnd1P25322 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccnd1P25322 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccnd1P25322 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccnd1P25322 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccnd1P25322 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccnd1P25322 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccnd1P25322 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccnd1P25322 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccnd1P25322 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccnd1P25322 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccnd1P25322 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccnd1P25322 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccnd1P25322 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccnd1P25322 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccnd1P25322 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccnd1P25322 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccnd1P25322 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccnd1P25322 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccnd1P25322 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccnd1P25322 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccnd1P25322 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccnd1P25322 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccnd1P25322 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccnd1P25322 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccnd1P25322 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccnd1P25322 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccnd1P25322 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccnd1P25322 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccnd1P25322 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccnd1P25322 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccnd1P25322 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccnd1P25322 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccnd1P25322 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccnd1P25322 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccnd1P25322 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccnd1P25322 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccnd1P25322 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccnd1P25322 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccnd1P25322 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccnd1P25322 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccnd1P25322 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccnd1P25322 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccnd1P25322 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccnd1P25322 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccnd1P25322 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccnd1P25322 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccnd1P25322 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccnd1P25322 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccnd1P25322 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccnd1P25322 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccnd1P25322 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccnd1P25322 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccnd1P25322 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccnd1P25322 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccnd1P25322 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccnd1P25322 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccnd1P25322 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccnd1P25322 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccnd1P25322 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccnd1P25322 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccnd1P25322 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccnd1P25322 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccnd1P25322 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccnd1P25322 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccnd1P25322 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccnd1P25322 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccnd1P25322 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccnd1P25322 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccnd1P25322 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccnd1P25322 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccnd1P25322 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccnd1P25322 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccnd1P25322 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccnd1P25322 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms