Protein–RNA interactions for Protein: P21995

Emb, Embigin, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EmbP21995 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EmbP21995 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EmbP21995 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EmbP21995 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EmbP21995 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EmbP21995 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EmbP21995 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EmbP21995 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EmbP21995 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EmbP21995 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
EmbP21995 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EmbP21995 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
EmbP21995 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EmbP21995 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EmbP21995 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
EmbP21995 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EmbP21995 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EmbP21995 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EmbP21995 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EmbP21995 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EmbP21995 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EmbP21995 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EmbP21995 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EmbP21995 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EmbP21995 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EmbP21995 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EmbP21995 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EmbP21995 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EmbP21995 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EmbP21995 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EmbP21995 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EmbP21995 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EmbP21995 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EmbP21995 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EmbP21995 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EmbP21995 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EmbP21995 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EmbP21995 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EmbP21995 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EmbP21995 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EmbP21995 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EmbP21995 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EmbP21995 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EmbP21995 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EmbP21995 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EmbP21995 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
EmbP21995 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
EmbP21995 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
EmbP21995 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
EmbP21995 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
EmbP21995 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
EmbP21995 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EmbP21995 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EmbP21995 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EmbP21995 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EmbP21995 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EmbP21995 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EmbP21995 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EmbP21995 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EmbP21995 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EmbP21995 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EmbP21995 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
EmbP21995 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EmbP21995 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EmbP21995 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EmbP21995 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EmbP21995 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EmbP21995 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
EmbP21995 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EmbP21995 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
EmbP21995 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EmbP21995 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
EmbP21995 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EmbP21995 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.52■■■□□ 2
EmbP21995 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EmbP21995 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EmbP21995 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EmbP21995 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EmbP21995 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EmbP21995 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EmbP21995 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
EmbP21995 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EmbP21995 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EmbP21995 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EmbP21995 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EmbP21995 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
EmbP21995 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EmbP21995 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EmbP21995 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EmbP21995 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
EmbP21995 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EmbP21995 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EmbP21995 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EmbP21995 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EmbP21995 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EmbP21995 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EmbP21995 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EmbP21995 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EmbP21995 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EmbP21995 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms