Protein–RNA interactions for Protein: P12850

Cxcl1, Growth-regulated alpha protein, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl1P12850 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cxcl1P12850 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cxcl1P12850 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cxcl1P12850 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cxcl1P12850 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cxcl1P12850 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cxcl1P12850 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cxcl1P12850 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cxcl1P12850 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cxcl1P12850 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cxcl1P12850 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cxcl1P12850 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cxcl1P12850 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cxcl1P12850 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cxcl1P12850 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cxcl1P12850 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cxcl1P12850 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cxcl1P12850 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cxcl1P12850 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cxcl1P12850 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cxcl1P12850 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cxcl1P12850 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cxcl1P12850 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cxcl1P12850 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cxcl1P12850 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cxcl1P12850 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cxcl1P12850 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cxcl1P12850 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cxcl1P12850 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cxcl1P12850 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cxcl1P12850 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cxcl1P12850 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cxcl1P12850 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cxcl1P12850 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cxcl1P12850 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cxcl1P12850 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cxcl1P12850 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cxcl1P12850 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cxcl1P12850 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cxcl1P12850 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cxcl1P12850 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cxcl1P12850 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cxcl1P12850 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cxcl1P12850 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cxcl1P12850 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cxcl1P12850 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cxcl1P12850 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cxcl1P12850 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cxcl1P12850 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cxcl1P12850 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cxcl1P12850 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cxcl1P12850 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cxcl1P12850 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cxcl1P12850 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cxcl1P12850 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cxcl1P12850 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cxcl1P12850 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cxcl1P12850 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cxcl1P12850 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cxcl1P12850 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cxcl1P12850 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cxcl1P12850 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cxcl1P12850 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cxcl1P12850 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cxcl1P12850 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cxcl1P12850 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cxcl1P12850 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cxcl1P12850 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cxcl1P12850 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cxcl1P12850 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cxcl1P12850 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cxcl1P12850 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cxcl1P12850 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cxcl1P12850 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cxcl1P12850 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cxcl1P12850 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cxcl1P12850 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cxcl1P12850 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cxcl1P12850 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cxcl1P12850 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cxcl1P12850 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Cxcl1P12850 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cxcl1P12850 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cxcl1P12850 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Cxcl1P12850 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cxcl1P12850 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cxcl1P12850 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cxcl1P12850 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cxcl1P12850 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cxcl1P12850 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cxcl1P12850 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cxcl1P12850 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cxcl1P12850 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cxcl1P12850 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cxcl1P12850 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Cxcl1P12850 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cxcl1P12850 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cxcl1P12850 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cxcl1P12850 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cxcl1P12850 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms