Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa1P11477 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa1P11477 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa1P11477 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa1P11477 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa1P11477 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa1P11477 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa1P11477 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Defa1P11477 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Defa1P11477 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Defa1P11477 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa1P11477 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa1P11477 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa1P11477 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Defa1P11477 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Defa1P11477 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Defa1P11477 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Defa1P11477 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Defa1P11477 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Defa1P11477 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Defa1P11477 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Defa1P11477 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Defa1P11477 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Defa1P11477 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Defa1P11477 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Defa1P11477 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Defa1P11477 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Defa1P11477 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Defa1P11477 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa1P11477 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa1P11477 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa1P11477 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa1P11477 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa1P11477 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa1P11477 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa1P11477 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa1P11477 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa1P11477 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Defa1P11477 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Defa1P11477 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Defa1P11477 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Defa1P11477 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa1P11477 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa1P11477 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa1P11477 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa1P11477 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa1P11477 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Defa1P11477 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Defa1P11477 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa1P11477 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa1P11477 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa1P11477 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa1P11477 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa1P11477 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa1P11477 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa1P11477 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa1P11477 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa1P11477 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa1P11477 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa1P11477 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa1P11477 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa1P11477 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa1P11477 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa1P11477 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Defa1P11477 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa1P11477 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa1P11477 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa1P11477 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa1P11477 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa1P11477 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Defa1P11477 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Defa1P11477 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Defa1P11477 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Defa1P11477 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Defa1P11477 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Defa1P11477 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Defa1P11477 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Defa1P11477 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Defa1P11477 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Defa1P11477 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Defa1P11477 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Defa1P11477 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Defa1P11477 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Defa1P11477 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Defa1P11477 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Defa1P11477 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Defa1P11477 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa1P11477 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa1P11477 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Defa1P11477 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Defa1P11477 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Defa1P11477 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Defa1P11477 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa1P11477 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa1P11477 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa1P11477 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa1P11477 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Defa1P11477 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa1P11477 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa1P11477 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms