Protein–RNA interactions for Protein: P11440

Cdk1, Cyclin-dependent kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk1P11440 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk1P11440 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdk1P11440 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdk1P11440 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdk1P11440 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdk1P11440 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdk1P11440 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdk1P11440 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdk1P11440 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk1P11440 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk1P11440 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk1P11440 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk1P11440 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk1P11440 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk1P11440 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdk1P11440 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdk1P11440 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk1P11440 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk1P11440 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk1P11440 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk1P11440 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk1P11440 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk1P11440 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdk1P11440 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdk1P11440 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdk1P11440 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cdk1P11440 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk1P11440 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk1P11440 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk1P11440 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdk1P11440 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdk1P11440 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdk1P11440 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdk1P11440 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdk1P11440 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdk1P11440 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdk1P11440 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdk1P11440 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk1P11440 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk1P11440 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk1P11440 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk1P11440 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk1P11440 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk1P11440 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk1P11440 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk1P11440 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk1P11440 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk1P11440 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk1P11440 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk1P11440 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk1P11440 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdk1P11440 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdk1P11440 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdk1P11440 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdk1P11440 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk1P11440 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk1P11440 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk1P11440 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdk1P11440 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk1P11440 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk1P11440 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk1P11440 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk1P11440 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk1P11440 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cdk1P11440 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk1P11440 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk1P11440 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk1P11440 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk1P11440 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk1P11440 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk1P11440 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk1P11440 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk1P11440 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk1P11440 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk1P11440 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk1P11440 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk1P11440 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk1P11440 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk1P11440 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk1P11440 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk1P11440 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk1P11440 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk1P11440 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk1P11440 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk1P11440 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk1P11440 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdk1P11440 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk1P11440 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk1P11440 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk1P11440 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdk1P11440 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdk1P11440 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdk1P11440 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdk1P11440 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk1P11440 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk1P11440 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk1P11440 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk1P11440 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdk1P11440 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk1P11440 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms