Protein–RNA interactions for Protein: P10598

Csn2, Beta-casein, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn2P10598 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Csn2P10598 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Csn2P10598 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Csn2P10598 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Csn2P10598 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Csn2P10598 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Csn2P10598 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Csn2P10598 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Csn2P10598 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Csn2P10598 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Csn2P10598 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Csn2P10598 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Csn2P10598 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Csn2P10598 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Csn2P10598 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Csn2P10598 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Csn2P10598 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Csn2P10598 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csn2P10598 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csn2P10598 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csn2P10598 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csn2P10598 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csn2P10598 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Csn2P10598 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csn2P10598 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csn2P10598 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csn2P10598 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csn2P10598 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csn2P10598 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csn2P10598 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csn2P10598 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csn2P10598 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csn2P10598 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csn2P10598 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csn2P10598 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csn2P10598 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csn2P10598 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csn2P10598 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csn2P10598 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csn2P10598 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csn2P10598 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csn2P10598 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csn2P10598 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csn2P10598 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csn2P10598 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csn2P10598 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csn2P10598 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csn2P10598 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csn2P10598 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csn2P10598 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csn2P10598 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csn2P10598 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csn2P10598 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csn2P10598 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csn2P10598 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csn2P10598 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csn2P10598 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csn2P10598 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csn2P10598 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csn2P10598 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csn2P10598 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csn2P10598 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csn2P10598 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csn2P10598 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csn2P10598 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Csn2P10598 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Csn2P10598 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Csn2P10598 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csn2P10598 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csn2P10598 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csn2P10598 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Csn2P10598 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Csn2P10598 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Csn2P10598 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Csn2P10598 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csn2P10598 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csn2P10598 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csn2P10598 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Csn2P10598 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Csn2P10598 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csn2P10598 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csn2P10598 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csn2P10598 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csn2P10598 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csn2P10598 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csn2P10598 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csn2P10598 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csn2P10598 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csn2P10598 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csn2P10598 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csn2P10598 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csn2P10598 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csn2P10598 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csn2P10598 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csn2P10598 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csn2P10598 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csn2P10598 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csn2P10598 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csn2P10598 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csn2P10598 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms