Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Amd1P0DMN7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Amd1P0DMN7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Amd1P0DMN7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Amd1P0DMN7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Amd1P0DMN7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Amd1P0DMN7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Amd1P0DMN7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Amd1P0DMN7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Amd1P0DMN7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Amd1P0DMN7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Amd1P0DMN7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Amd1P0DMN7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Amd1P0DMN7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Amd1P0DMN7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Amd1P0DMN7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Amd1P0DMN7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Amd1P0DMN7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Amd1P0DMN7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Amd1P0DMN7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Amd1P0DMN7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Amd1P0DMN7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Amd1P0DMN7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Amd1P0DMN7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Amd1P0DMN7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Amd1P0DMN7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Amd1P0DMN7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Amd1P0DMN7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Amd1P0DMN7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Amd1P0DMN7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Amd1P0DMN7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Amd1P0DMN7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Amd1P0DMN7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Amd1P0DMN7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Amd1P0DMN7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Amd1P0DMN7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Amd1P0DMN7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Amd1P0DMN7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Amd1P0DMN7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Amd1P0DMN7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Amd1P0DMN7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Amd1P0DMN7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Amd1P0DMN7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Amd1P0DMN7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Amd1P0DMN7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Amd1P0DMN7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Amd1P0DMN7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Amd1P0DMN7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Amd1P0DMN7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Amd1P0DMN7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Amd1P0DMN7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Amd1P0DMN7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Amd1P0DMN7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Amd1P0DMN7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Amd1P0DMN7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Amd1P0DMN7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Amd1P0DMN7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Amd1P0DMN7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Amd1P0DMN7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Amd1P0DMN7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Amd1P0DMN7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Amd1P0DMN7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Amd1P0DMN7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Amd1P0DMN7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Amd1P0DMN7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Amd1P0DMN7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Amd1P0DMN7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Amd1P0DMN7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Amd1P0DMN7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Amd1P0DMN7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Amd1P0DMN7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Amd1P0DMN7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Amd1P0DMN7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Amd1P0DMN7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Amd1P0DMN7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Amd1P0DMN7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Amd1P0DMN7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Amd1P0DMN7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Amd1P0DMN7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Amd1P0DMN7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Amd1P0DMN7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Amd1P0DMN7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Amd1P0DMN7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Amd1P0DMN7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Amd1P0DMN7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Amd1P0DMN7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Amd1P0DMN7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Amd1P0DMN7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Amd1P0DMN7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Amd1P0DMN7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Amd1P0DMN7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Amd1P0DMN7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Amd1P0DMN7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Amd1P0DMN7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Amd1P0DMN7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Amd1P0DMN7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Amd1P0DMN7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Amd1P0DMN7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Amd1P0DMN7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Amd1P0DMN7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms