Protein–RNA interactions for Protein: P09690

Chrnb1, Acetylcholine receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb1P09690 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chrnb1P09690 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chrnb1P09690 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chrnb1P09690 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chrnb1P09690 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chrnb1P09690 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chrnb1P09690 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chrnb1P09690 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chrnb1P09690 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrnb1P09690 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrnb1P09690 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chrnb1P09690 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chrnb1P09690 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Chrnb1P09690 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chrnb1P09690 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chrnb1P09690 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chrnb1P09690 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chrnb1P09690 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chrnb1P09690 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrnb1P09690 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrnb1P09690 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chrnb1P09690 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chrnb1P09690 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chrnb1P09690 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chrnb1P09690 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chrnb1P09690 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrnb1P09690 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chrnb1P09690 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chrnb1P09690 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chrnb1P09690 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrnb1P09690 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrnb1P09690 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrnb1P09690 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chrnb1P09690 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chrnb1P09690 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Chrnb1P09690 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chrnb1P09690 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chrnb1P09690 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chrnb1P09690 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chrnb1P09690 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chrnb1P09690 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chrnb1P09690 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chrnb1P09690 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chrnb1P09690 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chrnb1P09690 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chrnb1P09690 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chrnb1P09690 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chrnb1P09690 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chrnb1P09690 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chrnb1P09690 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chrnb1P09690 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chrnb1P09690 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chrnb1P09690 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chrnb1P09690 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chrnb1P09690 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chrnb1P09690 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chrnb1P09690 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chrnb1P09690 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chrnb1P09690 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chrnb1P09690 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chrnb1P09690 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chrnb1P09690 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chrnb1P09690 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chrnb1P09690 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chrnb1P09690 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chrnb1P09690 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chrnb1P09690 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chrnb1P09690 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Chrnb1P09690 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chrnb1P09690 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chrnb1P09690 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chrnb1P09690 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chrnb1P09690 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chrnb1P09690 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrnb1P09690 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrnb1P09690 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chrnb1P09690 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chrnb1P09690 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chrnb1P09690 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chrnb1P09690 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrnb1P09690 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrnb1P09690 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrnb1P09690 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrnb1P09690 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrnb1P09690 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chrnb1P09690 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chrnb1P09690 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chrnb1P09690 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chrnb1P09690 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Chrnb1P09690 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chrnb1P09690 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chrnb1P09690 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chrnb1P09690 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chrnb1P09690 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chrnb1P09690 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chrnb1P09690 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Chrnb1P09690 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chrnb1P09690 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chrnb1P09690 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Chrnb1P09690 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms