Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxa5P09021 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxa5P09021 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxa5P09021 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hoxa5P09021 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxa5P09021 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxa5P09021 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxa5P09021 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxa5P09021 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxa5P09021 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxa5P09021 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxa5P09021 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxa5P09021 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxa5P09021 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxa5P09021 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxa5P09021 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxa5P09021 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxa5P09021 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxa5P09021 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxa5P09021 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa5P09021 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa5P09021 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa5P09021 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa5P09021 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxa5P09021 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa5P09021 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa5P09021 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa5P09021 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa5P09021 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa5P09021 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa5P09021 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa5P09021 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa5P09021 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxa5P09021 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa5P09021 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa5P09021 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa5P09021 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa5P09021 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa5P09021 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa5P09021 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa5P09021 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa5P09021 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa5P09021 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa5P09021 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa5P09021 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa5P09021 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa5P09021 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxa5P09021 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxa5P09021 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxa5P09021 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxa5P09021 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxa5P09021 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxa5P09021 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa5P09021 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa5P09021 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxa5P09021 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxa5P09021 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxa5P09021 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxa5P09021 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxa5P09021 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxa5P09021 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxa5P09021 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxa5P09021 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxa5P09021 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxa5P09021 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxa5P09021 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxa5P09021 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxa5P09021 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxa5P09021 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxa5P09021 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxa5P09021 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxa5P09021 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxa5P09021 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxa5P09021 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxa5P09021 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxa5P09021 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxa5P09021 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxa5P09021 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxa5P09021 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxa5P09021 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxa5P09021 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxa5P09021 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxa5P09021 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxa5P09021 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxa5P09021 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxa5P09021 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxa5P09021 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxa5P09021 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxa5P09021 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxa5P09021 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxa5P09021 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hoxa5P09021 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxa5P09021 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxa5P09021 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxa5P09021 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxa5P09021 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxa5P09021 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxa5P09021 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxa5P09021 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxa5P09021 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms