Protein–RNA interactions for Protein: P08551

Nefl, Neurofilament light polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeflP08551 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NeflP08551 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
NeflP08551 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
NeflP08551 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NeflP08551 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
NeflP08551 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NeflP08551 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NeflP08551 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NeflP08551 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NeflP08551 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NeflP08551 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NeflP08551 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NeflP08551 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NeflP08551 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NeflP08551 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NeflP08551 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
NeflP08551 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NeflP08551 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NeflP08551 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
NeflP08551 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NeflP08551 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NeflP08551 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
NeflP08551 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NeflP08551 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
NeflP08551 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
NeflP08551 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NeflP08551 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NeflP08551 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NeflP08551 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.91
NeflP08551 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NeflP08551 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NeflP08551 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NeflP08551 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
NeflP08551 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NeflP08551 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NeflP08551 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NeflP08551 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NeflP08551 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NeflP08551 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NeflP08551 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NeflP08551 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NeflP08551 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NeflP08551 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NeflP08551 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NeflP08551 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
NeflP08551 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NeflP08551 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NeflP08551 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
NeflP08551 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
NeflP08551 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NeflP08551 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
NeflP08551 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
NeflP08551 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NeflP08551 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
NeflP08551 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
NeflP08551 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NeflP08551 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NeflP08551 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NeflP08551 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
NeflP08551 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
NeflP08551 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NeflP08551 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NeflP08551 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
NeflP08551 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
NeflP08551 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NeflP08551 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NeflP08551 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NeflP08551 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
NeflP08551 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
NeflP08551 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
NeflP08551 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
NeflP08551 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NeflP08551 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NeflP08551 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NeflP08551 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NeflP08551 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
NeflP08551 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
NeflP08551 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NeflP08551 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
NeflP08551 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
NeflP08551 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
NeflP08551 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
NeflP08551 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NeflP08551 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NeflP08551 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NeflP08551 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NeflP08551 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NeflP08551 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NeflP08551 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
NeflP08551 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
NeflP08551 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
NeflP08551 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
NeflP08551 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NeflP08551 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
NeflP08551 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
NeflP08551 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NeflP08551 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NeflP08551 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NeflP08551 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
NeflP08551 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms