Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TtrP07309 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TtrP07309 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TtrP07309 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TtrP07309 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TtrP07309 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TtrP07309 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TtrP07309 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TtrP07309 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TtrP07309 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TtrP07309 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TtrP07309 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TtrP07309 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TtrP07309 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TtrP07309 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TtrP07309 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TtrP07309 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TtrP07309 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TtrP07309 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TtrP07309 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TtrP07309 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TtrP07309 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TtrP07309 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TtrP07309 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TtrP07309 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TtrP07309 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TtrP07309 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TtrP07309 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TtrP07309 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TtrP07309 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TtrP07309 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TtrP07309 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TtrP07309 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TtrP07309 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TtrP07309 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TtrP07309 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TtrP07309 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TtrP07309 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TtrP07309 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TtrP07309 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TtrP07309 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TtrP07309 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TtrP07309 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TtrP07309 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TtrP07309 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TtrP07309 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TtrP07309 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TtrP07309 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TtrP07309 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TtrP07309 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TtrP07309 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TtrP07309 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TtrP07309 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TtrP07309 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TtrP07309 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TtrP07309 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TtrP07309 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TtrP07309 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TtrP07309 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TtrP07309 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TtrP07309 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TtrP07309 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TtrP07309 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TtrP07309 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TtrP07309 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TtrP07309 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TtrP07309 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TtrP07309 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TtrP07309 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TtrP07309 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TtrP07309 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TtrP07309 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TtrP07309 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TtrP07309 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TtrP07309 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TtrP07309 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TtrP07309 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TtrP07309 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TtrP07309 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TtrP07309 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TtrP07309 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TtrP07309 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TtrP07309 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TtrP07309 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TtrP07309 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
TtrP07309 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TtrP07309 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TtrP07309 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TtrP07309 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TtrP07309 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TtrP07309 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TtrP07309 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TtrP07309 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TtrP07309 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TtrP07309 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TtrP07309 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TtrP07309 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TtrP07309 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TtrP07309 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TtrP07309 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms