Protein–RNA interactions for Protein: P04444

Hbb-bh1, Hemoglobin subunit beta-H1, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh1P04444 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hbb-bh1P04444 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hbb-bh1P04444 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hbb-bh1P04444 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hbb-bh1P04444 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hbb-bh1P04444 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hbb-bh1P04444 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hbb-bh1P04444 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hbb-bh1P04444 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hbb-bh1P04444 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hbb-bh1P04444 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hbb-bh1P04444 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hbb-bh1P04444 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hbb-bh1P04444 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hbb-bh1P04444 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hbb-bh1P04444 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hbb-bh1P04444 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Hbb-bh1P04444 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hbb-bh1P04444 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hbb-bh1P04444 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hbb-bh1P04444 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hbb-bh1P04444 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hbb-bh1P04444 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hbb-bh1P04444 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hbb-bh1P04444 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hbb-bh1P04444 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hbb-bh1P04444 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hbb-bh1P04444 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hbb-bh1P04444 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hbb-bh1P04444 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hbb-bh1P04444 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hbb-bh1P04444 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hbb-bh1P04444 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hbb-bh1P04444 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hbb-bh1P04444 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hbb-bh1P04444 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hbb-bh1P04444 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hbb-bh1P04444 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hbb-bh1P04444 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hbb-bh1P04444 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hbb-bh1P04444 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hbb-bh1P04444 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hbb-bh1P04444 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hbb-bh1P04444 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hbb-bh1P04444 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hbb-bh1P04444 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hbb-bh1P04444 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hbb-bh1P04444 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hbb-bh1P04444 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hbb-bh1P04444 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hbb-bh1P04444 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hbb-bh1P04444 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hbb-bh1P04444 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hbb-bh1P04444 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hbb-bh1P04444 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hbb-bh1P04444 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hbb-bh1P04444 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Hbb-bh1P04444 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hbb-bh1P04444 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hbb-bh1P04444 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hbb-bh1P04444 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hbb-bh1P04444 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hbb-bh1P04444 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hbb-bh1P04444 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hbb-bh1P04444 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Hbb-bh1P04444 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hbb-bh1P04444 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hbb-bh1P04444 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Hbb-bh1P04444 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hbb-bh1P04444 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hbb-bh1P04444 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hbb-bh1P04444 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hbb-bh1P04444 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hbb-bh1P04444 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hbb-bh1P04444 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hbb-bh1P04444 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hbb-bh1P04444 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hbb-bh1P04444 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hbb-bh1P04444 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hbb-bh1P04444 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hbb-bh1P04444 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hbb-bh1P04444 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hbb-bh1P04444 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hbb-bh1P04444 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hbb-bh1P04444 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hbb-bh1P04444 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hbb-bh1P04444 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hbb-bh1P04444 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hbb-bh1P04444 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hbb-bh1P04444 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hbb-bh1P04444 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hbb-bh1P04444 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hbb-bh1P04444 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hbb-bh1P04444 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hbb-bh1P04444 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hbb-bh1P04444 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hbb-bh1P04444 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hbb-bh1P04444 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hbb-bh1P04444 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hbb-bh1P04444 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms