Protein–RNA interactions for Protein: P04247

Mb, Myoglobin, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MbP04247 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MbP04247 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MbP04247 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MbP04247 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MbP04247 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MbP04247 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MbP04247 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MbP04247 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MbP04247 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MbP04247 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MbP04247 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MbP04247 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MbP04247 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MbP04247 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MbP04247 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MbP04247 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MbP04247 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MbP04247 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MbP04247 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MbP04247 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MbP04247 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MbP04247 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MbP04247 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MbP04247 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MbP04247 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MbP04247 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MbP04247 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MbP04247 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MbP04247 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MbP04247 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MbP04247 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MbP04247 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MbP04247 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MbP04247 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
MbP04247 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MbP04247 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MbP04247 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MbP04247 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MbP04247 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MbP04247 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MbP04247 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MbP04247 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MbP04247 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MbP04247 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MbP04247 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MbP04247 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MbP04247 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MbP04247 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MbP04247 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MbP04247 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MbP04247 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MbP04247 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MbP04247 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MbP04247 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MbP04247 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MbP04247 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MbP04247 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MbP04247 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MbP04247 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MbP04247 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MbP04247 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MbP04247 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MbP04247 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MbP04247 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MbP04247 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MbP04247 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MbP04247 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MbP04247 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MbP04247 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MbP04247 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MbP04247 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MbP04247 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MbP04247 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MbP04247 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MbP04247 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MbP04247 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MbP04247 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MbP04247 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MbP04247 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MbP04247 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MbP04247 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MbP04247 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MbP04247 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MbP04247 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MbP04247 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MbP04247 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MbP04247 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MbP04247 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MbP04247 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MbP04247 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MbP04247 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MbP04247 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MbP04247 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MbP04247 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MbP04247 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MbP04247 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MbP04247 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MbP04247 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MbP04247 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MbP04247 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms