Protein–RNA interactions for Protein: P04224

H-2 class II histocompatibility antigen, E-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04224 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P04224 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
P04224 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
P04224 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P04224 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
P04224 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P04224 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P04224 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
P04224 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
P04224 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P04224 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P04224 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
P04224 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P04224 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P04224 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
P04224 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P04224 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P04224 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
P04224 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
P04224 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P04224 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P04224 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P04224 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P04224 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P04224 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
P04224 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P04224 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
P04224 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
P04224 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
P04224 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P04224 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
P04224 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P04224 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P04224 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P04224 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P04224 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P04224 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P04224 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P04224 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P04224 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
P04224 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
P04224 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P04224 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
P04224 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
P04224 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P04224 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
P04224 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
P04224 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
P04224 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
P04224 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
P04224 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
P04224 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P04224 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P04224 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
P04224 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P04224 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P04224 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P04224 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P04224 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P04224 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
P04224 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P04224 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
P04224 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
P04224 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P04224 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P04224 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P04224 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
P04224 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P04224 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P04224 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
P04224 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P04224 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
P04224 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P04224 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P04224 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P04224 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P04224 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P04224 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P04224 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P04224 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
P04224 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
P04224 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
P04224 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
P04224 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
P04224 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P04224 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
P04224 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
P04224 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
P04224 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P04224 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P04224 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
P04224 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
P04224 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
P04224 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P04224 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P04224 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
P04224 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
P04224 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
P04224 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P04224 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms