Protein–RNA interactions for Protein: P01898

H2-Q10, H-2 class I histocompatibility antigen, Q10 alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q10P01898 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2-Q10P01898 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2-Q10P01898 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2-Q10P01898 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2-Q10P01898 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2-Q10P01898 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2-Q10P01898 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
H2-Q10P01898 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
H2-Q10P01898 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2-Q10P01898 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2-Q10P01898 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2-Q10P01898 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2-Q10P01898 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2-Q10P01898 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2-Q10P01898 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2-Q10P01898 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
H2-Q10P01898 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2-Q10P01898 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2-Q10P01898 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2-Q10P01898 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2-Q10P01898 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2-Q10P01898 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-Q10P01898 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-Q10P01898 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-Q10P01898 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-Q10P01898 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-Q10P01898 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-Q10P01898 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-Q10P01898 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2-Q10P01898 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-Q10P01898 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
H2-Q10P01898 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2-Q10P01898 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2-Q10P01898 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-Q10P01898 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-Q10P01898 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-Q10P01898 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-Q10P01898 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-Q10P01898 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-Q10P01898 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2-Q10P01898 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2-Q10P01898 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-Q10P01898 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-Q10P01898 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-Q10P01898 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-Q10P01898 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-Q10P01898 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-Q10P01898 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2-Q10P01898 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2-Q10P01898 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
H2-Q10P01898 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-Q10P01898 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-Q10P01898 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-Q10P01898 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-Q10P01898 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-Q10P01898 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-Q10P01898 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
H2-Q10P01898 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2-Q10P01898 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-Q10P01898 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2-Q10P01898 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2-Q10P01898 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2-Q10P01898 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2-Q10P01898 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2-Q10P01898 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2-Q10P01898 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2-Q10P01898 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-Q10P01898 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2-Q10P01898 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2-Q10P01898 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2-Q10P01898 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2-Q10P01898 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-Q10P01898 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-Q10P01898 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-Q10P01898 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-Q10P01898 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-Q10P01898 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-Q10P01898 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-Q10P01898 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2-Q10P01898 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-Q10P01898 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-Q10P01898 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-Q10P01898 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-Q10P01898 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-Q10P01898 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
H2-Q10P01898 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-Q10P01898 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-Q10P01898 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-Q10P01898 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-Q10P01898 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-Q10P01898 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-Q10P01898 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-Q10P01898 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-Q10P01898 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-Q10P01898 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-Q10P01898 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-Q10P01898 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-Q10P01898 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-Q10P01898 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-Q10P01898 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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