Protein–RNA interactions for Protein: P01736

T-cell receptor beta chain V region PHDS203 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01736 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,13■□□□□ 0,65
P01736 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,13■□□□□ 0,65
P01736 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,11■□□□□ 0,65
P01736 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,11■□□□□ 0,65
P01736 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC19,11■□□□□ 0,65
P01736 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19,1■□□□□ 0,65
P01736 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19,1■□□□□ 0,65
P01736 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,1■□□□□ 0,65
P01736 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC19,09■□□□□ 0,65
P01736 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,09■□□□□ 0,65
P01736 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19,09■□□□□ 0,65
P01736 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,09■□□□□ 0,65
P01736 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,08■□□□□ 0,64
P01736 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19,08■□□□□ 0,64
P01736 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,07■□□□□ 0,64
P01736 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC19,06■□□□□ 0,64
P01736 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,06■□□□□ 0,64
P01736 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,06■□□□□ 0,64
P01736 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,06■□□□□ 0,64
P01736 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,05■□□□□ 0,64
P01736 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,05■□□□□ 0,64
P01736 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19,04■□□□□ 0,64
P01736 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,04■□□□□ 0,64
P01736 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC19,04■□□□□ 0,64
P01736 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,02■□□□□ 0,64
P01736 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,02■□□□□ 0,63
P01736 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC19,01■□□□□ 0,63
P01736 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,01■□□□□ 0,63
P01736 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,01■□□□□ 0,63
P01736 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,99■□□□□ 0,63
P01736 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18,99■□□□□ 0,63
P01736 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,99■□□□□ 0,63
P01736 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,99■□□□□ 0,63
P01736 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,99■□□□□ 0,63
P01736 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18,98■□□□□ 0,63
P01736 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,98■□□□□ 0,63
P01736 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,98■□□□□ 0,63
P01736 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18,97■□□□□ 0,63
P01736 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18,97■□□□□ 0,63
P01736 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18,97■□□□□ 0,63
P01736 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC18,96■□□□□ 0,63
P01736 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18,95■□□□□ 0,62
P01736 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,93■□□□□ 0,62
P01736 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,91■□□□□ 0,62
P01736 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,9■□□□□ 0,62
P01736 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18,88■□□□□ 0,61
P01736 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,88■□□□□ 0,61
P01736 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,88■□□□□ 0,61
P01736 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,88■□□□□ 0,61
P01736 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,88■□□□□ 0,61
P01736 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC18,87■□□□□ 0,61
P01736 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,86■□□□□ 0,61
P01736 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC18,86■□□□□ 0,61
P01736 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,86■□□□□ 0,61
P01736 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18,86■□□□□ 0,61
P01736 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,86■□□□□ 0,61
P01736 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18,85■□□□□ 0,61
P01736 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18,84■□□□□ 0,61
P01736 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC18,84■□□□□ 0,61
P01736 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,84■□□□□ 0,61
P01736 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,83■□□□□ 0,6
P01736 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,83■□□□□ 0,6
P01736 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,83■□□□□ 0,6
P01736 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18,83■□□□□ 0,6
P01736 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18,82■□□□□ 0,6
P01736 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18,82■□□□□ 0,6
P01736 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,81■□□□□ 0,6
P01736 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18,81■□□□□ 0,6
P01736 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC18,81■□□□□ 0,6
P01736 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18,8■□□□□ 0,6
P01736 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18,8■□□□□ 0,6
P01736 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,79■□□□□ 0,6
P01736 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18,78■□□□□ 0,6
P01736 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC18,78■□□□□ 0,6
P01736 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,77■□□□□ 0,59
P01736 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,76■□□□□ 0,59
P01736 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,76■□□□□ 0,59
P01736 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,75■□□□□ 0,59
P01736 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,74■□□□□ 0,59
P01736 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,73■□□□□ 0,59
P01736 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,73■□□□□ 0,59
P01736 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,73■□□□□ 0,59
P01736 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18,72■□□□□ 0,59
P01736 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18,71■□□□□ 0,59
P01736 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18,71■□□□□ 0,59
P01736 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,7■□□□□ 0,58
P01736 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18,69■□□□□ 0,58
P01736 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18,68■□□□□ 0,58
P01736 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,68■□□□□ 0,58
P01736 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,68■□□□□ 0,58
P01736 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18,68■□□□□ 0,58
P01736 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,67■□□□□ 0,58
P01736 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,67■□□□□ 0,58
P01736 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC18,67■□□□□ 0,58
P01736 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,67■□□□□ 0,58
P01736 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18,67■□□□□ 0,58
P01736 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,66■□□□□ 0,58
P01736 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,65■□□□□ 0,58
P01736 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,65■□□□□ 0,58
P01736 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,65■□□□□ 0,58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms