Protein–RNA interactions for Protein: P01659

Ig kappa chain V-III region TEPC 124, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01659 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
P01659 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
P01659 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
P01659 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
P01659 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
P01659 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
P01659 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
P01659 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
P01659 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
P01659 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
P01659 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
P01659 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P01659 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P01659 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
P01659 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
P01659 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
P01659 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
P01659 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
P01659 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
P01659 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P01659 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
P01659 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01659 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01659 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01659 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01659 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01659 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01659 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01659 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01659 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01659 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01659 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01659 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01659 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01659 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01659 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
P01659 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
P01659 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
P01659 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
P01659 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
P01659 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
P01659 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01659 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01659 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01659 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01659 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01659 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01659 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01659 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01659 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01659 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01659 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01659 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
P01659 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
P01659 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
P01659 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
P01659 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01659 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01659 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P01659 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P01659 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P01659 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P01659 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P01659 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01659 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P01659 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
P01659 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
P01659 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
P01659 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P01659 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01659 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P01659 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01659 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01659 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01659 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01659 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01659 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01659 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01659 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01659 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01659 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01659 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01659 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01659 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01659 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01659 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01659 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01659 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01659 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01659 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01659 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01659 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01659 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01659 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01659 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01659 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
P01659 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
P01659 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
P01659 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P01659 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms