Protein–RNA interactions for Protein: O88705

Hcn3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn3O88705 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hcn3O88705 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Hcn3O88705 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hcn3O88705 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hcn3O88705 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hcn3O88705 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hcn3O88705 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hcn3O88705 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hcn3O88705 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hcn3O88705 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hcn3O88705 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hcn3O88705 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hcn3O88705 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hcn3O88705 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hcn3O88705 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hcn3O88705 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hcn3O88705 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hcn3O88705 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hcn3O88705 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hcn3O88705 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hcn3O88705 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hcn3O88705 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Hcn3O88705 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hcn3O88705 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hcn3O88705 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Hcn3O88705 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hcn3O88705 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hcn3O88705 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hcn3O88705 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hcn3O88705 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hcn3O88705 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hcn3O88705 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Hcn3O88705 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hcn3O88705 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hcn3O88705 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hcn3O88705 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hcn3O88705 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hcn3O88705 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hcn3O88705 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hcn3O88705 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hcn3O88705 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hcn3O88705 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hcn3O88705 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hcn3O88705 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hcn3O88705 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hcn3O88705 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hcn3O88705 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hcn3O88705 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hcn3O88705 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hcn3O88705 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hcn3O88705 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hcn3O88705 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hcn3O88705 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hcn3O88705 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hcn3O88705 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hcn3O88705 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hcn3O88705 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hcn3O88705 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hcn3O88705 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hcn3O88705 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hcn3O88705 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hcn3O88705 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hcn3O88705 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hcn3O88705 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hcn3O88705 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Hcn3O88705 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hcn3O88705 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hcn3O88705 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hcn3O88705 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hcn3O88705 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hcn3O88705 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hcn3O88705 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hcn3O88705 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hcn3O88705 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hcn3O88705 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hcn3O88705 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hcn3O88705 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hcn3O88705 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hcn3O88705 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hcn3O88705 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hcn3O88705 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hcn3O88705 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hcn3O88705 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hcn3O88705 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Hcn3O88705 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Hcn3O88705 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hcn3O88705 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hcn3O88705 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hcn3O88705 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Hcn3O88705 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hcn3O88705 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hcn3O88705 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hcn3O88705 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hcn3O88705 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hcn3O88705 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hcn3O88705 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hcn3O88705 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hcn3O88705 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hcn3O88705 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hcn3O88705 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms