Protein–RNA interactions for Protein: O88413

Tulp3, Tubby-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp3O88413 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tulp3O88413 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tulp3O88413 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tulp3O88413 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tulp3O88413 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tulp3O88413 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tulp3O88413 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tulp3O88413 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tulp3O88413 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tulp3O88413 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tulp3O88413 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tulp3O88413 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tulp3O88413 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tulp3O88413 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Tulp3O88413 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tulp3O88413 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tulp3O88413 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tulp3O88413 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tulp3O88413 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Tulp3O88413 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tulp3O88413 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tulp3O88413 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tulp3O88413 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tulp3O88413 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tulp3O88413 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tulp3O88413 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tulp3O88413 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tulp3O88413 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tulp3O88413 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tulp3O88413 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tulp3O88413 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tulp3O88413 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Tulp3O88413 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Tulp3O88413 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tulp3O88413 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tulp3O88413 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tulp3O88413 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tulp3O88413 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tulp3O88413 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tulp3O88413 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tulp3O88413 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Tulp3O88413 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tulp3O88413 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tulp3O88413 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tulp3O88413 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tulp3O88413 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tulp3O88413 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tulp3O88413 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tulp3O88413 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tulp3O88413 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tulp3O88413 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tulp3O88413 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tulp3O88413 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tulp3O88413 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tulp3O88413 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tulp3O88413 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tulp3O88413 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tulp3O88413 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tulp3O88413 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Tulp3O88413 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tulp3O88413 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tulp3O88413 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tulp3O88413 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tulp3O88413 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tulp3O88413 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tulp3O88413 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tulp3O88413 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tulp3O88413 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tulp3O88413 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tulp3O88413 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tulp3O88413 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tulp3O88413 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tulp3O88413 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tulp3O88413 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tulp3O88413 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tulp3O88413 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tulp3O88413 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tulp3O88413 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tulp3O88413 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tulp3O88413 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tulp3O88413 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tulp3O88413 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tulp3O88413 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tulp3O88413 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tulp3O88413 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tulp3O88413 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tulp3O88413 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tulp3O88413 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tulp3O88413 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tulp3O88413 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tulp3O88413 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tulp3O88413 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tulp3O88413 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Tulp3O88413 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tulp3O88413 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tulp3O88413 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tulp3O88413 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tulp3O88413 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tulp3O88413 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tulp3O88413 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 187.9 ms