Protein–RNA interactions for Protein: O88338

Cdh16, Cadherin-16, mousemouse

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh16O88338 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdh16O88338 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdh16O88338 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdh16O88338 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdh16O88338 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdh16O88338 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdh16O88338 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdh16O88338 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdh16O88338 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdh16O88338 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdh16O88338 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdh16O88338 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdh16O88338 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdh16O88338 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdh16O88338 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdh16O88338 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdh16O88338 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdh16O88338 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdh16O88338 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdh16O88338 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdh16O88338 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdh16O88338 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdh16O88338 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdh16O88338 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdh16O88338 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdh16O88338 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdh16O88338 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdh16O88338 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdh16O88338 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdh16O88338 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdh16O88338 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cdh16O88338 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdh16O88338 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdh16O88338 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdh16O88338 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdh16O88338 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdh16O88338 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdh16O88338 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdh16O88338 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdh16O88338 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdh16O88338 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdh16O88338 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdh16O88338 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdh16O88338 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdh16O88338 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdh16O88338 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdh16O88338 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdh16O88338 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdh16O88338 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Cdh16O88338 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdh16O88338 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdh16O88338 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdh16O88338 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdh16O88338 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdh16O88338 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdh16O88338 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdh16O88338 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdh16O88338 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdh16O88338 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdh16O88338 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdh16O88338 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdh16O88338 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdh16O88338 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdh16O88338 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdh16O88338 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdh16O88338 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdh16O88338 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cdh16O88338 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cdh16O88338 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdh16O88338 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdh16O88338 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdh16O88338 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdh16O88338 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdh16O88338 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdh16O88338 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdh16O88338 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdh16O88338 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdh16O88338 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdh16O88338 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdh16O88338 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdh16O88338 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdh16O88338 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdh16O88338 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdh16O88338 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdh16O88338 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdh16O88338 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdh16O88338 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdh16O88338 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdh16O88338 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdh16O88338 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdh16O88338 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdh16O88338 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdh16O88338 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdh16O88338 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdh16O88338 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdh16O88338 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdh16O88338 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdh16O88338 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdh16O88338 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdh16O88338 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms