Protein–RNA interactions for Protein: O54724

Cavin1, Caveolae-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin1O54724 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29,18■■■□□ 2,26
Cavin1O54724 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Cavin1O54724 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Cavin1O54724 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Cavin1O54724 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Cavin1O54724 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Cavin1O54724 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Cavin1O54724 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Cavin1O54724 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2,23
Cavin1O54724 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Cavin1O54724 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,99■■■□□ 2,23
Cavin1O54724 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Cavin1O54724 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28,98■■■□□ 2,23
Cavin1O54724 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Cavin1O54724 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Cavin1O54724 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,23
Cavin1O54724 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Cavin1O54724 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Cavin1O54724 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Cavin1O54724 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Cavin1O54724 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,93■■■□□ 2,22
Cavin1O54724 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Cavin1O54724 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,92■■■□□ 2,22
Cavin1O54724 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28,92■■■□□ 2,22
Cavin1O54724 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Cavin1O54724 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,91■■■□□ 2,22
Cavin1O54724 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Cavin1O54724 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Cavin1O54724 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Cavin1O54724 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,21
Cavin1O54724 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Cavin1O54724 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Cavin1O54724 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28,87■■■□□ 2,21
Cavin1O54724 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28,87■■■□□ 2,21
Cavin1O54724 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,86■■■□□ 2,21
Cavin1O54724 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28,85■■■□□ 2,21
Cavin1O54724 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Cavin1O54724 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,84■■■□□ 2,21
Cavin1O54724 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Cavin1O54724 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28,8■■■□□ 2,2
Cavin1O54724 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Cavin1O54724 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28,79■■■□□ 2,2
Cavin1O54724 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,78■■■□□ 2,2
Cavin1O54724 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Cavin1O54724 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Cavin1O54724 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Cavin1O54724 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Cavin1O54724 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,76■■■□□ 2,19
Cavin1O54724 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28,76■■■□□ 2,19
Cavin1O54724 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28,75■■■□□ 2,19
Cavin1O54724 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Cavin1O54724 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Cavin1O54724 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Cavin1O54724 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Cavin1O54724 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Cavin1O54724 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Cavin1O54724 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Cavin1O54724 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,19
Cavin1O54724 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
Cavin1O54724 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
Cavin1O54724 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Cavin1O54724 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Cavin1O54724 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Cavin1O54724 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28,66■■■□□ 2,18
Cavin1O54724 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Cavin1O54724 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28,65■■■□□ 2,18
Cavin1O54724 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Cavin1O54724 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,64■■■□□ 2,17
Cavin1O54724 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Cavin1O54724 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Cavin1O54724 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Cavin1O54724 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,59■■■□□ 2,17
Cavin1O54724 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Cavin1O54724 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28,56■■■□□ 2,16
Cavin1O54724 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Cavin1O54724 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,55■■■□□ 2,16
Cavin1O54724 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Cavin1O54724 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28,54■■■□□ 2,16
Cavin1O54724 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Cavin1O54724 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28,52■■■□□ 2,16
Cavin1O54724 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Cavin1O54724 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Cavin1O54724 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Cavin1O54724 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Cavin1O54724 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28,49■■■□□ 2,15
Cavin1O54724 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28,47■■■□□ 2,15
Cavin1O54724 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Cavin1O54724 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28,45■■■□□ 2,15
Cavin1O54724 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Cavin1O54724 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,42■■■□□ 2,14
Cavin1O54724 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Cavin1O54724 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Cavin1O54724 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,36■■■□□ 2,13
Cavin1O54724 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,36■■■□□ 2,13
Cavin1O54724 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Cavin1O54724 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Cavin1O54724 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28,33■■■□□ 2,13
Cavin1O54724 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Cavin1O54724 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Cavin1O54724 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22,2 ms