Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Xbp1O35426 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Xbp1O35426 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Xbp1O35426 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Xbp1O35426 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Xbp1O35426 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Xbp1O35426 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Xbp1O35426 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Xbp1O35426 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Xbp1O35426 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Xbp1O35426 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Xbp1O35426 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Xbp1O35426 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Xbp1O35426 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Xbp1O35426 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Xbp1O35426 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Xbp1O35426 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Xbp1O35426 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Xbp1O35426 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Xbp1O35426 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Xbp1O35426 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Xbp1O35426 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Xbp1O35426 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Xbp1O35426 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Xbp1O35426 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Xbp1O35426 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Xbp1O35426 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Xbp1O35426 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Xbp1O35426 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Xbp1O35426 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Xbp1O35426 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Xbp1O35426 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Xbp1O35426 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Xbp1O35426 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Xbp1O35426 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Xbp1O35426 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Xbp1O35426 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Xbp1O35426 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Xbp1O35426 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Xbp1O35426 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Xbp1O35426 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Xbp1O35426 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Xbp1O35426 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Xbp1O35426 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Xbp1O35426 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Xbp1O35426 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Xbp1O35426 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Xbp1O35426 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Xbp1O35426 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Xbp1O35426 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Xbp1O35426 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Xbp1O35426 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Xbp1O35426 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Xbp1O35426 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Xbp1O35426 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Xbp1O35426 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Xbp1O35426 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Xbp1O35426 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Xbp1O35426 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Xbp1O35426 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Xbp1O35426 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Xbp1O35426 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Xbp1O35426 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Xbp1O35426 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Xbp1O35426 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Xbp1O35426 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Xbp1O35426 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Xbp1O35426 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Xbp1O35426 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Xbp1O35426 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Xbp1O35426 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Xbp1O35426 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Xbp1O35426 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Xbp1O35426 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Xbp1O35426 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Xbp1O35426 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Xbp1O35426 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Xbp1O35426 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Xbp1O35426 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Xbp1O35426 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Xbp1O35426 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Xbp1O35426 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Xbp1O35426 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Xbp1O35426 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Xbp1O35426 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Xbp1O35426 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Xbp1O35426 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Xbp1O35426 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Xbp1O35426 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Xbp1O35426 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Xbp1O35426 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Xbp1O35426 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Xbp1O35426 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Xbp1O35426 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Xbp1O35426 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Xbp1O35426 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Xbp1O35426 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Xbp1O35426 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Xbp1O35426 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Xbp1O35426 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms