Protein–RNA interactions for Protein: O35308

Slc16a8, Monocarboxylate transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc16a8O35308 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc16a8O35308 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc16a8O35308 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc16a8O35308 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc16a8O35308 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc16a8O35308 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc16a8O35308 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc16a8O35308 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc16a8O35308 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc16a8O35308 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc16a8O35308 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc16a8O35308 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc16a8O35308 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc16a8O35308 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc16a8O35308 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc16a8O35308 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc16a8O35308 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc16a8O35308 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc16a8O35308 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Slc16a8O35308 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc16a8O35308 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc16a8O35308 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc16a8O35308 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc16a8O35308 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc16a8O35308 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slc16a8O35308 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc16a8O35308 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc16a8O35308 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc16a8O35308 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc16a8O35308 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc16a8O35308 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc16a8O35308 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc16a8O35308 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc16a8O35308 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc16a8O35308 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc16a8O35308 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc16a8O35308 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc16a8O35308 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc16a8O35308 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc16a8O35308 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Slc16a8O35308 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc16a8O35308 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc16a8O35308 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc16a8O35308 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc16a8O35308 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc16a8O35308 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc16a8O35308 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc16a8O35308 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc16a8O35308 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc16a8O35308 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc16a8O35308 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc16a8O35308 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc16a8O35308 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc16a8O35308 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc16a8O35308 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc16a8O35308 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc16a8O35308 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc16a8O35308 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc16a8O35308 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc16a8O35308 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc16a8O35308 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc16a8O35308 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc16a8O35308 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc16a8O35308 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc16a8O35308 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc16a8O35308 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc16a8O35308 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc16a8O35308 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc16a8O35308 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc16a8O35308 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc16a8O35308 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc16a8O35308 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc16a8O35308 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc16a8O35308 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc16a8O35308 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc16a8O35308 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc16a8O35308 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc16a8O35308 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc16a8O35308 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc16a8O35308 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc16a8O35308 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc16a8O35308 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc16a8O35308 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc16a8O35308 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc16a8O35308 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc16a8O35308 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc16a8O35308 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc16a8O35308 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc16a8O35308 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc16a8O35308 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc16a8O35308 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc16a8O35308 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc16a8O35308 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Slc16a8O35308 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc16a8O35308 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc16a8O35308 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc16a8O35308 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc16a8O35308 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc16a8O35308 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc16a8O35308 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms