Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC38,36■■■■□ 3,73
Pkd2O35245 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC38,33■■■■□ 3,73
Pkd2O35245 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC38,31■■■■□ 3,72
Pkd2O35245 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC38,29■■■■□ 3,72
Pkd2O35245 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,29■■■■□ 3,72
Pkd2O35245 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,28■■■■□ 3,72
Pkd2O35245 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,27■■■■□ 3,72
Pkd2O35245 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC38,27■■■■□ 3,72
Pkd2O35245 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,25■■■■□ 3,71
Pkd2O35245 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,24■■■■□ 3,71
Pkd2O35245 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38,24■■■■□ 3,71
Pkd2O35245 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC38,22■■■■□ 3,71
Pkd2O35245 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,2■■■■□ 3,71
Pkd2O35245 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,19■■■■□ 3,7
Pkd2O35245 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC38,18■■■■□ 3,7
Pkd2O35245 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,17■■■■□ 3,7
Pkd2O35245 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,16■■■■□ 3,7
Pkd2O35245 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,15■■■■□ 3,7
Pkd2O35245 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,13■■■■□ 3,69
Pkd2O35245 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC38,12■■■■□ 3,69
Pkd2O35245 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,12■■■■□ 3,69
Pkd2O35245 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC38,11■■■■□ 3,69
Pkd2O35245 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC38,1■■■■□ 3,69
Pkd2O35245 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC38,09■■■■□ 3,69
Pkd2O35245 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC38,08■■■■□ 3,69
Pkd2O35245 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC38,08■■■■□ 3,69
Pkd2O35245 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38,06■■■■□ 3,68
Pkd2O35245 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,05■■■■□ 3,68
Pkd2O35245 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38,04■■■■□ 3,68
Pkd2O35245 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC38,03■■■■□ 3,68
Pkd2O35245 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC37,99■■■■□ 3,67
Pkd2O35245 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37,98■■■■□ 3,67
Pkd2O35245 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC37,98■■■■□ 3,67
Pkd2O35245 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,96■■■■□ 3,67
Pkd2O35245 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC37,95■■■■□ 3,67
Pkd2O35245 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC37,93■■■■□ 3,66
Pkd2O35245 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC37,92■■■■□ 3,66
Pkd2O35245 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC37,92■■■■□ 3,66
Pkd2O35245 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,89■■■■□ 3,66
Pkd2O35245 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC37,88■■■■□ 3,65
Pkd2O35245 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC37,87■■■■□ 3,65
Pkd2O35245 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37,83■■■■□ 3,65
Pkd2O35245 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC37,82■■■■□ 3,64
Pkd2O35245 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,81■■■■□ 3,64
Pkd2O35245 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC37,8■■■■□ 3,64
Pkd2O35245 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37,77■■■■□ 3,64
Pkd2O35245 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,76■■■■□ 3,64
Pkd2O35245 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,76■■■■□ 3,63
Pkd2O35245 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC37,72■■■■□ 3,63
Pkd2O35245 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,69■■■■□ 3,62
Pkd2O35245 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC37,68■■■■□ 3,62
Pkd2O35245 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC37,68■■■■□ 3,62
Pkd2O35245 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,68■■■■□ 3,62
Pkd2O35245 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,64■■■■□ 3,62
Pkd2O35245 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC37,63■■■■□ 3,61
Pkd2O35245 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC37,63■■■■□ 3,61
Pkd2O35245 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC37,59■■■■□ 3,61
Pkd2O35245 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,59■■■■□ 3,61
Pkd2O35245 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,58■■■■□ 3,61
Pkd2O35245 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC37,55■■■■□ 3,6
Pkd2O35245 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,51■■■■□ 3,6
Pkd2O35245 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC37,5■■■■□ 3,59
Pkd2O35245 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37,5■■■■□ 3,59
Pkd2O35245 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37,49■■■■□ 3,59
Pkd2O35245 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,49■■■■□ 3,59
Pkd2O35245 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC37,48■■■■□ 3,59
Pkd2O35245 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC37,47■■■■□ 3,59
Pkd2O35245 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,47■■■■□ 3,59
Pkd2O35245 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,46■■■■□ 3,59
Pkd2O35245 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,46■■■■□ 3,59
Pkd2O35245 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC37,45■■■■□ 3,59
Pkd2O35245 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,45■■■■□ 3,59
Pkd2O35245 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC37,45■■■■□ 3,59
Pkd2O35245 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,43■■■■□ 3,58
Pkd2O35245 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC37,42■■■■□ 3,58
Pkd2O35245 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC37,42■■■■□ 3,58
Pkd2O35245 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,39■■■■□ 3,58
Pkd2O35245 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,38■■■■□ 3,57
Pkd2O35245 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC37,38■■■■□ 3,57
Pkd2O35245 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37,36■■■■□ 3,57
Pkd2O35245 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37,34■■■■□ 3,57
Pkd2O35245 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,33■■■■□ 3,57
Pkd2O35245 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,29■■■■□ 3,56
Pkd2O35245 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC37,29■■■■□ 3,56
Pkd2O35245 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37,28■■■■□ 3,56
Pkd2O35245 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,27■■■■□ 3,56
Pkd2O35245 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,25■■■■□ 3,55
Pkd2O35245 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,25■■■■□ 3,55
Pkd2O35245 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,25■■■■□ 3,55
Pkd2O35245 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,24■■■■□ 3,55
Pkd2O35245 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,24■■■■□ 3,55
Pkd2O35245 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,23■■■■□ 3,55
Pkd2O35245 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC37,21■■■■□ 3,55
Pkd2O35245 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,21■■■■□ 3,55
Pkd2O35245 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC37,18■■■■□ 3,54
Pkd2O35245 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,17■■■■□ 3,54
Pkd2O35245 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,17■■■■□ 3,54
Pkd2O35245 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC37,16■■■■□ 3,54
Pkd2O35245 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,15■■■■□ 3,54
Pkd2O35245 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC37,14■■■■□ 3,54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,5 ms