Protein–RNA interactions for Protein: O35127

Grcc10, Protein C10, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grcc10O35127 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Grcc10O35127 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Grcc10O35127 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grcc10O35127 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grcc10O35127 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grcc10O35127 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Grcc10O35127 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Grcc10O35127 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Grcc10O35127 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Grcc10O35127 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Grcc10O35127 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Grcc10O35127 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Grcc10O35127 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Grcc10O35127 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Grcc10O35127 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Grcc10O35127 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Grcc10O35127 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Grcc10O35127 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grcc10O35127 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Grcc10O35127 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Grcc10O35127 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Grcc10O35127 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Grcc10O35127 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Grcc10O35127 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Grcc10O35127 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Grcc10O35127 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Grcc10O35127 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grcc10O35127 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grcc10O35127 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Grcc10O35127 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Grcc10O35127 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Grcc10O35127 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Grcc10O35127 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grcc10O35127 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grcc10O35127 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grcc10O35127 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grcc10O35127 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grcc10O35127 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grcc10O35127 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grcc10O35127 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grcc10O35127 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grcc10O35127 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grcc10O35127 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grcc10O35127 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grcc10O35127 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grcc10O35127 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grcc10O35127 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grcc10O35127 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grcc10O35127 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grcc10O35127 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grcc10O35127 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grcc10O35127 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grcc10O35127 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Grcc10O35127 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Grcc10O35127 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grcc10O35127 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Grcc10O35127 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Grcc10O35127 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grcc10O35127 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grcc10O35127 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grcc10O35127 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grcc10O35127 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grcc10O35127 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grcc10O35127 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grcc10O35127 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grcc10O35127 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grcc10O35127 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grcc10O35127 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grcc10O35127 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grcc10O35127 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grcc10O35127 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grcc10O35127 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grcc10O35127 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Grcc10O35127 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grcc10O35127 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grcc10O35127 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grcc10O35127 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grcc10O35127 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grcc10O35127 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grcc10O35127 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grcc10O35127 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grcc10O35127 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grcc10O35127 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grcc10O35127 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Grcc10O35127 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grcc10O35127 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grcc10O35127 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grcc10O35127 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grcc10O35127 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grcc10O35127 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grcc10O35127 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grcc10O35127 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grcc10O35127 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grcc10O35127 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grcc10O35127 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grcc10O35127 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grcc10O35127 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grcc10O35127 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grcc10O35127 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grcc10O35127 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms