Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Eftud2O08810 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Eftud2O08810 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Eftud2O08810 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Eftud2O08810 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Eftud2O08810 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Eftud2O08810 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Eftud2O08810 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Eftud2O08810 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Eftud2O08810 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Eftud2O08810 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Eftud2O08810 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Eftud2O08810 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Eftud2O08810 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Eftud2O08810 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Eftud2O08810 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Eftud2O08810 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Eftud2O08810 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Eftud2O08810 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Eftud2O08810 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Eftud2O08810 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Eftud2O08810 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Eftud2O08810 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Eftud2O08810 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Eftud2O08810 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Eftud2O08810 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Eftud2O08810 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Eftud2O08810 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Eftud2O08810 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Eftud2O08810 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Eftud2O08810 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Eftud2O08810 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Eftud2O08810 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Eftud2O08810 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Eftud2O08810 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Eftud2O08810 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Eftud2O08810 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Eftud2O08810 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Eftud2O08810 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Eftud2O08810 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Eftud2O08810 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Eftud2O08810 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Eftud2O08810 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Eftud2O08810 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Eftud2O08810 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Eftud2O08810 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Eftud2O08810 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Eftud2O08810 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Eftud2O08810 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Eftud2O08810 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Eftud2O08810 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Eftud2O08810 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Eftud2O08810 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Eftud2O08810 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Eftud2O08810 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Eftud2O08810 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Eftud2O08810 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Eftud2O08810 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Eftud2O08810 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Eftud2O08810 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Eftud2O08810 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Eftud2O08810 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Eftud2O08810 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Eftud2O08810 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Eftud2O08810 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Eftud2O08810 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Eftud2O08810 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Eftud2O08810 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Eftud2O08810 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Eftud2O08810 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Eftud2O08810 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Eftud2O08810 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Eftud2O08810 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Eftud2O08810 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Eftud2O08810 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Eftud2O08810 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Eftud2O08810 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Eftud2O08810 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Eftud2O08810 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Eftud2O08810 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Eftud2O08810 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Eftud2O08810 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Eftud2O08810 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Eftud2O08810 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Eftud2O08810 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Eftud2O08810 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Eftud2O08810 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Eftud2O08810 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Eftud2O08810 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Eftud2O08810 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Eftud2O08810 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Eftud2O08810 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Eftud2O08810 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Eftud2O08810 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Eftud2O08810 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Eftud2O08810 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Eftud2O08810 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Eftud2O08810 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Eftud2O08810 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Eftud2O08810 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms