Protein–RNA interactions for Protein: O08529

Capn2, Calpain-2 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn2O08529 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Capn2O08529 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Capn2O08529 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Capn2O08529 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Capn2O08529 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Capn2O08529 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Capn2O08529 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Capn2O08529 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Capn2O08529 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Capn2O08529 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Capn2O08529 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Capn2O08529 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Capn2O08529 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Capn2O08529 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Capn2O08529 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Capn2O08529 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Capn2O08529 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Capn2O08529 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Capn2O08529 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Capn2O08529 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Capn2O08529 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Capn2O08529 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Capn2O08529 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Capn2O08529 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Capn2O08529 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Capn2O08529 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Capn2O08529 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Capn2O08529 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Capn2O08529 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Capn2O08529 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Capn2O08529 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Capn2O08529 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Capn2O08529 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Capn2O08529 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Capn2O08529 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Capn2O08529 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Capn2O08529 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Capn2O08529 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Capn2O08529 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Capn2O08529 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Capn2O08529 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Capn2O08529 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Capn2O08529 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Capn2O08529 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Capn2O08529 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Capn2O08529 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Capn2O08529 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Capn2O08529 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Capn2O08529 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Capn2O08529 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Capn2O08529 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Capn2O08529 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Capn2O08529 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Capn2O08529 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Capn2O08529 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Capn2O08529 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Capn2O08529 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Capn2O08529 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Capn2O08529 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Capn2O08529 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Capn2O08529 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Capn2O08529 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Capn2O08529 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Capn2O08529 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Capn2O08529 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Capn2O08529 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Capn2O08529 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Capn2O08529 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Capn2O08529 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Capn2O08529 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Capn2O08529 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Capn2O08529 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Capn2O08529 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Capn2O08529 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Capn2O08529 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Capn2O08529 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Capn2O08529 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Capn2O08529 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Capn2O08529 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Capn2O08529 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Capn2O08529 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Capn2O08529 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Capn2O08529 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Capn2O08529 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Capn2O08529 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Capn2O08529 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Capn2O08529 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Capn2O08529 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Capn2O08529 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Capn2O08529 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Capn2O08529 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Capn2O08529 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Capn2O08529 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Capn2O08529 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Capn2O08529 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Capn2O08529 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Capn2O08529 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Capn2O08529 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Capn2O08529 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Capn2O08529 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms