Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm379J3QQ19 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm379J3QQ19 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm379J3QQ19 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm379J3QQ19 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm379J3QQ19 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm379J3QQ19 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm379J3QQ19 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm379J3QQ19 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm379J3QQ19 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm379J3QQ19 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm379J3QQ19 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm379J3QQ19 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm379J3QQ19 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm379J3QQ19 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm379J3QQ19 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm379J3QQ19 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm379J3QQ19 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm379J3QQ19 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm379J3QQ19 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm379J3QQ19 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm379J3QQ19 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm379J3QQ19 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm379J3QQ19 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm379J3QQ19 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm379J3QQ19 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm379J3QQ19 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm379J3QQ19 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm379J3QQ19 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gm379J3QQ19 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm379J3QQ19 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm379J3QQ19 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm379J3QQ19 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm379J3QQ19 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm379J3QQ19 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm379J3QQ19 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm379J3QQ19 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm379J3QQ19 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm379J3QQ19 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm379J3QQ19 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm379J3QQ19 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm379J3QQ19 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm379J3QQ19 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm379J3QQ19 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm379J3QQ19 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm379J3QQ19 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm379J3QQ19 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm379J3QQ19 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm379J3QQ19 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm379J3QQ19 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm379J3QQ19 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm379J3QQ19 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm379J3QQ19 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm379J3QQ19 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm379J3QQ19 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm379J3QQ19 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm379J3QQ19 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm379J3QQ19 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm379J3QQ19 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm379J3QQ19 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Gm379J3QQ19 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm379J3QQ19 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm379J3QQ19 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm379J3QQ19 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm379J3QQ19 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm379J3QQ19 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm379J3QQ19 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm379J3QQ19 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm379J3QQ19 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm379J3QQ19 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm379J3QQ19 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm379J3QQ19 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm379J3QQ19 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm379J3QQ19 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm379J3QQ19 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm379J3QQ19 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm379J3QQ19 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm379J3QQ19 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm379J3QQ19 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm379J3QQ19 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm379J3QQ19 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm379J3QQ19 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm379J3QQ19 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm379J3QQ19 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm379J3QQ19 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm379J3QQ19 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm379J3QQ19 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm379J3QQ19 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm379J3QQ19 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm379J3QQ19 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm379J3QQ19 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm379J3QQ19 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm379J3QQ19 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm379J3QQ19 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm379J3QQ19 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm379J3QQ19 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm379J3QQ19 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm379J3QQ19 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm379J3QQ19 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm379J3QQ19 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
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