Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3727J3QM54 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm3727J3QM54 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3727J3QM54 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3727J3QM54 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3727J3QM54 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3727J3QM54 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3727J3QM54 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3727J3QM54 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3727J3QM54 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3727J3QM54 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3727J3QM54 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3727J3QM54 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3727J3QM54 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3727J3QM54 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3727J3QM54 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3727J3QM54 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3727J3QM54 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3727J3QM54 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3727J3QM54 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3727J3QM54 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm3727J3QM54 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm3727J3QM54 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm3727J3QM54 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3727J3QM54 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3727J3QM54 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3727J3QM54 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3727J3QM54 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3727J3QM54 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3727J3QM54 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3727J3QM54 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3727J3QM54 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm3727J3QM54 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm3727J3QM54 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3727J3QM54 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3727J3QM54 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3727J3QM54 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3727J3QM54 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3727J3QM54 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3727J3QM54 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3727J3QM54 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3727J3QM54 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3727J3QM54 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3727J3QM54 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3727J3QM54 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3727J3QM54 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3727J3QM54 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3727J3QM54 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3727J3QM54 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3727J3QM54 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3727J3QM54 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3727J3QM54 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3727J3QM54 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3727J3QM54 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3727J3QM54 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm3727J3QM54 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm3727J3QM54 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm3727J3QM54 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3727J3QM54 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3727J3QM54 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3727J3QM54 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3727J3QM54 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3727J3QM54 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3727J3QM54 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3727J3QM54 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3727J3QM54 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3727J3QM54 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm3727J3QM54 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3727J3QM54 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3727J3QM54 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3727J3QM54 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3727J3QM54 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3727J3QM54 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3727J3QM54 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3727J3QM54 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3727J3QM54 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3727J3QM54 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3727J3QM54 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3727J3QM54 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3727J3QM54 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3727J3QM54 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3727J3QM54 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3727J3QM54 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3727J3QM54 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3727J3QM54 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3727J3QM54 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3727J3QM54 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3727J3QM54 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3727J3QM54 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3727J3QM54 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3727J3QM54 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3727J3QM54 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3727J3QM54 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3727J3QM54 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3727J3QM54 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3727J3QM54 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3727J3QM54 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3727J3QM54 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3727J3QM54 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3727J3QM54 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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