Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP5

Gm21897, Predicted gene, 21897, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21897J3KMP5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm21897J3KMP5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm21897J3KMP5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm21897J3KMP5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm21897J3KMP5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm21897J3KMP5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm21897J3KMP5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm21897J3KMP5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm21897J3KMP5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm21897J3KMP5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm21897J3KMP5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm21897J3KMP5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm21897J3KMP5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm21897J3KMP5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm21897J3KMP5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm21897J3KMP5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm21897J3KMP5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm21897J3KMP5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gm21897J3KMP5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm21897J3KMP5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm21897J3KMP5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm21897J3KMP5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm21897J3KMP5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm21897J3KMP5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm21897J3KMP5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm21897J3KMP5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm21897J3KMP5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm21897J3KMP5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm21897J3KMP5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm21897J3KMP5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm21897J3KMP5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm21897J3KMP5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Gm21897J3KMP5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm21897J3KMP5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm21897J3KMP5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm21897J3KMP5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm21897J3KMP5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm21897J3KMP5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm21897J3KMP5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm21897J3KMP5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm21897J3KMP5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm21897J3KMP5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm21897J3KMP5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm21897J3KMP5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm21897J3KMP5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gm21897J3KMP5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gm21897J3KMP5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm21897J3KMP5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm21897J3KMP5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm21897J3KMP5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm21897J3KMP5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm21897J3KMP5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm21897J3KMP5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm21897J3KMP5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm21897J3KMP5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm21897J3KMP5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm21897J3KMP5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm21897J3KMP5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm21897J3KMP5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm21897J3KMP5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm21897J3KMP5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm21897J3KMP5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm21897J3KMP5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm21897J3KMP5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm21897J3KMP5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm21897J3KMP5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm21897J3KMP5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm21897J3KMP5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm21897J3KMP5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm21897J3KMP5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm21897J3KMP5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm21897J3KMP5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm21897J3KMP5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm21897J3KMP5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm21897J3KMP5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm21897J3KMP5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm21897J3KMP5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm21897J3KMP5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm21897J3KMP5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm21897J3KMP5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm21897J3KMP5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm21897J3KMP5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm21897J3KMP5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm21897J3KMP5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm21897J3KMP5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm21897J3KMP5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm21897J3KMP5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm21897J3KMP5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm21897J3KMP5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm21897J3KMP5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm21897J3KMP5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm21897J3KMP5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm21897J3KMP5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm21897J3KMP5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm21897J3KMP5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm21897J3KMP5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm21897J3KMP5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm21897J3KMP5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm21897J3KMP5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm21897J3KMP5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms