Protein–RNA interactions for Protein: F7ANP4

Gm16506, Predicted gene 16506 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16506F7ANP4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm16506F7ANP4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm16506F7ANP4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm16506F7ANP4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm16506F7ANP4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm16506F7ANP4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm16506F7ANP4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm16506F7ANP4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm16506F7ANP4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm16506F7ANP4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm16506F7ANP4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm16506F7ANP4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm16506F7ANP4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm16506F7ANP4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm16506F7ANP4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm16506F7ANP4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm16506F7ANP4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm16506F7ANP4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm16506F7ANP4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm16506F7ANP4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm16506F7ANP4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm16506F7ANP4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm16506F7ANP4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm16506F7ANP4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm16506F7ANP4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm16506F7ANP4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm16506F7ANP4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm16506F7ANP4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm16506F7ANP4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm16506F7ANP4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm16506F7ANP4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm16506F7ANP4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm16506F7ANP4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm16506F7ANP4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm16506F7ANP4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm16506F7ANP4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm16506F7ANP4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm16506F7ANP4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm16506F7ANP4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm16506F7ANP4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm16506F7ANP4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm16506F7ANP4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm16506F7ANP4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm16506F7ANP4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm16506F7ANP4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm16506F7ANP4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm16506F7ANP4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm16506F7ANP4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm16506F7ANP4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Gm16506F7ANP4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm16506F7ANP4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm16506F7ANP4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm16506F7ANP4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm16506F7ANP4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm16506F7ANP4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm16506F7ANP4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm16506F7ANP4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm16506F7ANP4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm16506F7ANP4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm16506F7ANP4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm16506F7ANP4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm16506F7ANP4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm16506F7ANP4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm16506F7ANP4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm16506F7ANP4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm16506F7ANP4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm16506F7ANP4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm16506F7ANP4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm16506F7ANP4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm16506F7ANP4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm16506F7ANP4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm16506F7ANP4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm16506F7ANP4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm16506F7ANP4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm16506F7ANP4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm16506F7ANP4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm16506F7ANP4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm16506F7ANP4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm16506F7ANP4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm16506F7ANP4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm16506F7ANP4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Gm16506F7ANP4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm16506F7ANP4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm16506F7ANP4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm16506F7ANP4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm16506F7ANP4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm16506F7ANP4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm16506F7ANP4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm16506F7ANP4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm16506F7ANP4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm16506F7ANP4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm16506F7ANP4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm16506F7ANP4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm16506F7ANP4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm16506F7ANP4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm16506F7ANP4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm16506F7ANP4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm16506F7ANP4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm16506F7ANP4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm16506F7ANP4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms