Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm28305F6U473 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm28305F6U473 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm28305F6U473 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm28305F6U473 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm28305F6U473 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm28305F6U473 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm28305F6U473 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm28305F6U473 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm28305F6U473 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm28305F6U473 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm28305F6U473 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm28305F6U473 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm28305F6U473 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm28305F6U473 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm28305F6U473 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm28305F6U473 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm28305F6U473 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm28305F6U473 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm28305F6U473 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm28305F6U473 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm28305F6U473 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm28305F6U473 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm28305F6U473 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm28305F6U473 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm28305F6U473 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm28305F6U473 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm28305F6U473 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm28305F6U473 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm28305F6U473 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm28305F6U473 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm28305F6U473 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm28305F6U473 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm28305F6U473 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm28305F6U473 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm28305F6U473 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm28305F6U473 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm28305F6U473 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm28305F6U473 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm28305F6U473 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm28305F6U473 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm28305F6U473 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm28305F6U473 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm28305F6U473 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm28305F6U473 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm28305F6U473 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm28305F6U473 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm28305F6U473 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm28305F6U473 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm28305F6U473 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm28305F6U473 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm28305F6U473 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm28305F6U473 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm28305F6U473 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm28305F6U473 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm28305F6U473 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm28305F6U473 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm28305F6U473 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm28305F6U473 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm28305F6U473 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm28305F6U473 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm28305F6U473 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm28305F6U473 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm28305F6U473 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm28305F6U473 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm28305F6U473 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm28305F6U473 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm28305F6U473 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm28305F6U473 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm28305F6U473 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm28305F6U473 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm28305F6U473 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm28305F6U473 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm28305F6U473 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm28305F6U473 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm28305F6U473 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm28305F6U473 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm28305F6U473 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm28305F6U473 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm28305F6U473 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm28305F6U473 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm28305F6U473 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm28305F6U473 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm28305F6U473 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm28305F6U473 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm28305F6U473 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm28305F6U473 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm28305F6U473 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm28305F6U473 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm28305F6U473 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm28305F6U473 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm28305F6U473 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm28305F6U473 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gm28305F6U473 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gm28305F6U473 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm28305F6U473 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm28305F6U473 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm28305F6U473 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm28305F6U473 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm28305F6U473 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms