Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Syngap1F6SEU4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Syngap1F6SEU4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Syngap1F6SEU4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Syngap1F6SEU4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Syngap1F6SEU4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Syngap1F6SEU4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Syngap1F6SEU4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Syngap1F6SEU4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Syngap1F6SEU4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Syngap1F6SEU4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Syngap1F6SEU4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Syngap1F6SEU4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Syngap1F6SEU4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Syngap1F6SEU4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Syngap1F6SEU4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Syngap1F6SEU4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Syngap1F6SEU4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Syngap1F6SEU4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Syngap1F6SEU4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Syngap1F6SEU4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Syngap1F6SEU4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Syngap1F6SEU4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Syngap1F6SEU4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Syngap1F6SEU4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Syngap1F6SEU4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Syngap1F6SEU4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Syngap1F6SEU4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Syngap1F6SEU4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Syngap1F6SEU4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Syngap1F6SEU4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Syngap1F6SEU4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Syngap1F6SEU4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Syngap1F6SEU4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Syngap1F6SEU4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Syngap1F6SEU4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Syngap1F6SEU4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Syngap1F6SEU4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Syngap1F6SEU4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Syngap1F6SEU4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Syngap1F6SEU4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Syngap1F6SEU4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Syngap1F6SEU4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Syngap1F6SEU4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Syngap1F6SEU4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Syngap1F6SEU4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Syngap1F6SEU4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Syngap1F6SEU4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Syngap1F6SEU4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Syngap1F6SEU4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Syngap1F6SEU4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Syngap1F6SEU4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Syngap1F6SEU4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Syngap1F6SEU4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Syngap1F6SEU4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Syngap1F6SEU4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Syngap1F6SEU4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Syngap1F6SEU4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Syngap1F6SEU4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Syngap1F6SEU4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Syngap1F6SEU4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Syngap1F6SEU4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Syngap1F6SEU4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Syngap1F6SEU4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Syngap1F6SEU4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Syngap1F6SEU4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Syngap1F6SEU4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Syngap1F6SEU4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Syngap1F6SEU4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Syngap1F6SEU4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Syngap1F6SEU4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Syngap1F6SEU4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Syngap1F6SEU4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
Syngap1F6SEU4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Syngap1F6SEU4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Syngap1F6SEU4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Syngap1F6SEU4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Syngap1F6SEU4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Syngap1F6SEU4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Syngap1F6SEU4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Syngap1F6SEU4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Syngap1F6SEU4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Syngap1F6SEU4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Syngap1F6SEU4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Syngap1F6SEU4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Syngap1F6SEU4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Syngap1F6SEU4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Syngap1F6SEU4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Syngap1F6SEU4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Syngap1F6SEU4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Syngap1F6SEU4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Syngap1F6SEU4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Syngap1F6SEU4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Syngap1F6SEU4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Syngap1F6SEU4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Syngap1F6SEU4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Syngap1F6SEU4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Syngap1F6SEU4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Syngap1F6SEU4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Syngap1F6SEU4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms