Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
2610001J05RikF2Z3Y9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
2610001J05RikF2Z3Y9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
2610001J05RikF2Z3Y9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
2610001J05RikF2Z3Y9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
2610001J05RikF2Z3Y9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
2610001J05RikF2Z3Y9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
2610001J05RikF2Z3Y9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
2610001J05RikF2Z3Y9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
2610001J05RikF2Z3Y9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
2610001J05RikF2Z3Y9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
2610001J05RikF2Z3Y9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
2610001J05RikF2Z3Y9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
2610001J05RikF2Z3Y9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
2610001J05RikF2Z3Y9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
2610001J05RikF2Z3Y9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
2610001J05RikF2Z3Y9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
2610001J05RikF2Z3Y9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
2610001J05RikF2Z3Y9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
2610001J05RikF2Z3Y9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
2610001J05RikF2Z3Y9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
2610001J05RikF2Z3Y9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
2610001J05RikF2Z3Y9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
2610001J05RikF2Z3Y9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
2610001J05RikF2Z3Y9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
2610001J05RikF2Z3Y9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
2610001J05RikF2Z3Y9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
2610001J05RikF2Z3Y9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
2610001J05RikF2Z3Y9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
2610001J05RikF2Z3Y9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
2610001J05RikF2Z3Y9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
2610001J05RikF2Z3Y9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
2610001J05RikF2Z3Y9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
2610001J05RikF2Z3Y9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
2610001J05RikF2Z3Y9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
2610001J05RikF2Z3Y9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
2610001J05RikF2Z3Y9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
2610001J05RikF2Z3Y9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
2610001J05RikF2Z3Y9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
2610001J05RikF2Z3Y9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
2610001J05RikF2Z3Y9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
2610001J05RikF2Z3Y9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
2610001J05RikF2Z3Y9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
2610001J05RikF2Z3Y9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
2610001J05RikF2Z3Y9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms