Protein–RNA interactions for Protein: E9Q528

Gm17175, Predicted gene 17175, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17175E9Q528 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm17175E9Q528 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm17175E9Q528 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm17175E9Q528 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm17175E9Q528 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm17175E9Q528 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm17175E9Q528 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm17175E9Q528 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm17175E9Q528 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm17175E9Q528 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm17175E9Q528 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gm17175E9Q528 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm17175E9Q528 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm17175E9Q528 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm17175E9Q528 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm17175E9Q528 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm17175E9Q528 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm17175E9Q528 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm17175E9Q528 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm17175E9Q528 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm17175E9Q528 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm17175E9Q528 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm17175E9Q528 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm17175E9Q528 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm17175E9Q528 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm17175E9Q528 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gm17175E9Q528 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gm17175E9Q528 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm17175E9Q528 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm17175E9Q528 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm17175E9Q528 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm17175E9Q528 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm17175E9Q528 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm17175E9Q528 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm17175E9Q528 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm17175E9Q528 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm17175E9Q528 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm17175E9Q528 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm17175E9Q528 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gm17175E9Q528 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm17175E9Q528 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm17175E9Q528 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm17175E9Q528 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm17175E9Q528 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm17175E9Q528 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gm17175E9Q528 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm17175E9Q528 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm17175E9Q528 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm17175E9Q528 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm17175E9Q528 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm17175E9Q528 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm17175E9Q528 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm17175E9Q528 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm17175E9Q528 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm17175E9Q528 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm17175E9Q528 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm17175E9Q528 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm17175E9Q528 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm17175E9Q528 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm17175E9Q528 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm17175E9Q528 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm17175E9Q528 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm17175E9Q528 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm17175E9Q528 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm17175E9Q528 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm17175E9Q528 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm17175E9Q528 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm17175E9Q528 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm17175E9Q528 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm17175E9Q528 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm17175E9Q528 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm17175E9Q528 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm17175E9Q528 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm17175E9Q528 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm17175E9Q528 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm17175E9Q528 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm17175E9Q528 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm17175E9Q528 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm17175E9Q528 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm17175E9Q528 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm17175E9Q528 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm17175E9Q528 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm17175E9Q528 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm17175E9Q528 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm17175E9Q528 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gm17175E9Q528 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm17175E9Q528 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm17175E9Q528 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm17175E9Q528 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm17175E9Q528 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm17175E9Q528 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm17175E9Q528 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm17175E9Q528 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm17175E9Q528 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm17175E9Q528 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm17175E9Q528 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm17175E9Q528 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm17175E9Q528 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm17175E9Q528 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm17175E9Q528 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms