Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4Y3

4930546C10Rik, RIKEN cDNA 4930546C10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930546C10RikE9Q4Y3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930546C10RikE9Q4Y3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930546C10RikE9Q4Y3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930546C10RikE9Q4Y3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930546C10RikE9Q4Y3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930546C10RikE9Q4Y3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930546C10RikE9Q4Y3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930546C10RikE9Q4Y3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930546C10RikE9Q4Y3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930546C10RikE9Q4Y3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930546C10RikE9Q4Y3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930546C10RikE9Q4Y3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930546C10RikE9Q4Y3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930546C10RikE9Q4Y3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4930546C10RikE9Q4Y3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930546C10RikE9Q4Y3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930546C10RikE9Q4Y3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930546C10RikE9Q4Y3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930546C10RikE9Q4Y3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930546C10RikE9Q4Y3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930546C10RikE9Q4Y3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930546C10RikE9Q4Y3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930546C10RikE9Q4Y3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930546C10RikE9Q4Y3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930546C10RikE9Q4Y3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930546C10RikE9Q4Y3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930546C10RikE9Q4Y3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4930546C10RikE9Q4Y3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4930546C10RikE9Q4Y3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930546C10RikE9Q4Y3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930546C10RikE9Q4Y3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
4930546C10RikE9Q4Y3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930546C10RikE9Q4Y3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930546C10RikE9Q4Y3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930546C10RikE9Q4Y3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
4930546C10RikE9Q4Y3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930546C10RikE9Q4Y3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
4930546C10RikE9Q4Y3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930546C10RikE9Q4Y3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
4930546C10RikE9Q4Y3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930546C10RikE9Q4Y3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930546C10RikE9Q4Y3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930546C10RikE9Q4Y3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930546C10RikE9Q4Y3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930546C10RikE9Q4Y3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930546C10RikE9Q4Y3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930546C10RikE9Q4Y3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930546C10RikE9Q4Y3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930546C10RikE9Q4Y3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930546C10RikE9Q4Y3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
4930546C10RikE9Q4Y3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930546C10RikE9Q4Y3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930546C10RikE9Q4Y3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930546C10RikE9Q4Y3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930546C10RikE9Q4Y3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
4930546C10RikE9Q4Y3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
4930546C10RikE9Q4Y3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4930546C10RikE9Q4Y3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
4930546C10RikE9Q4Y3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4930546C10RikE9Q4Y3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4930546C10RikE9Q4Y3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4930546C10RikE9Q4Y3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4930546C10RikE9Q4Y3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930546C10RikE9Q4Y3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930546C10RikE9Q4Y3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930546C10RikE9Q4Y3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930546C10RikE9Q4Y3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930546C10RikE9Q4Y3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
4930546C10RikE9Q4Y3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930546C10RikE9Q4Y3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930546C10RikE9Q4Y3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930546C10RikE9Q4Y3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930546C10RikE9Q4Y3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930546C10RikE9Q4Y3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930546C10RikE9Q4Y3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930546C10RikE9Q4Y3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930546C10RikE9Q4Y3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930546C10RikE9Q4Y3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930546C10RikE9Q4Y3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930546C10RikE9Q4Y3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
4930546C10RikE9Q4Y3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930546C10RikE9Q4Y3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
4930546C10RikE9Q4Y3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930546C10RikE9Q4Y3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930546C10RikE9Q4Y3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930546C10RikE9Q4Y3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930546C10RikE9Q4Y3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930546C10RikE9Q4Y3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930546C10RikE9Q4Y3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930546C10RikE9Q4Y3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930546C10RikE9Q4Y3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930546C10RikE9Q4Y3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930546C10RikE9Q4Y3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930546C10RikE9Q4Y3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930546C10RikE9Q4Y3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930546C10RikE9Q4Y3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms