Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ2

1810011H11Rik, RIKEN cDNA 1810011H11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810011H11RikE9PVZ2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
1810011H11RikE9PVZ2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
1810011H11RikE9PVZ2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
1810011H11RikE9PVZ2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
1810011H11RikE9PVZ2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
1810011H11RikE9PVZ2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
1810011H11RikE9PVZ2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
1810011H11RikE9PVZ2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
1810011H11RikE9PVZ2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
1810011H11RikE9PVZ2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
1810011H11RikE9PVZ2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
1810011H11RikE9PVZ2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
1810011H11RikE9PVZ2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
1810011H11RikE9PVZ2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
1810011H11RikE9PVZ2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
1810011H11RikE9PVZ2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
1810011H11RikE9PVZ2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
1810011H11RikE9PVZ2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
1810011H11RikE9PVZ2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
1810011H11RikE9PVZ2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
1810011H11RikE9PVZ2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
1810011H11RikE9PVZ2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
1810011H11RikE9PVZ2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
1810011H11RikE9PVZ2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
1810011H11RikE9PVZ2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
1810011H11RikE9PVZ2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
1810011H11RikE9PVZ2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
1810011H11RikE9PVZ2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
1810011H11RikE9PVZ2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
1810011H11RikE9PVZ2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
1810011H11RikE9PVZ2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
1810011H11RikE9PVZ2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
1810011H11RikE9PVZ2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
1810011H11RikE9PVZ2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
1810011H11RikE9PVZ2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
1810011H11RikE9PVZ2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
1810011H11RikE9PVZ2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
1810011H11RikE9PVZ2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
1810011H11RikE9PVZ2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
1810011H11RikE9PVZ2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
1810011H11RikE9PVZ2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
1810011H11RikE9PVZ2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
1810011H11RikE9PVZ2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
1810011H11RikE9PVZ2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
1810011H11RikE9PVZ2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
1810011H11RikE9PVZ2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
1810011H11RikE9PVZ2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
1810011H11RikE9PVZ2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
1810011H11RikE9PVZ2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1810011H11RikE9PVZ2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1810011H11RikE9PVZ2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1810011H11RikE9PVZ2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
1810011H11RikE9PVZ2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
1810011H11RikE9PVZ2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
1810011H11RikE9PVZ2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
1810011H11RikE9PVZ2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1810011H11RikE9PVZ2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1810011H11RikE9PVZ2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1810011H11RikE9PVZ2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1810011H11RikE9PVZ2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
1810011H11RikE9PVZ2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
1810011H11RikE9PVZ2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
1810011H11RikE9PVZ2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1810011H11RikE9PVZ2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1810011H11RikE9PVZ2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
1810011H11RikE9PVZ2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
1810011H11RikE9PVZ2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
1810011H11RikE9PVZ2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
1810011H11RikE9PVZ2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
1810011H11RikE9PVZ2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
1810011H11RikE9PVZ2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
1810011H11RikE9PVZ2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
1810011H11RikE9PVZ2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1810011H11RikE9PVZ2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1810011H11RikE9PVZ2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
1810011H11RikE9PVZ2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1810011H11RikE9PVZ2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1810011H11RikE9PVZ2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
1810011H11RikE9PVZ2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
1810011H11RikE9PVZ2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
1810011H11RikE9PVZ2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
1810011H11RikE9PVZ2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
1810011H11RikE9PVZ2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
1810011H11RikE9PVZ2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
1810011H11RikE9PVZ2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
1810011H11RikE9PVZ2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
1810011H11RikE9PVZ2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
1810011H11RikE9PVZ2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
1810011H11RikE9PVZ2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
1810011H11RikE9PVZ2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
1810011H11RikE9PVZ2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
1810011H11RikE9PVZ2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1810011H11RikE9PVZ2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
1810011H11RikE9PVZ2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
1810011H11RikE9PVZ2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
1810011H11RikE9PVZ2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1810011H11RikE9PVZ2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
1810011H11RikE9PVZ2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
1810011H11RikE9PVZ2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
1810011H11RikE9PVZ2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms