Protein–RNA interactions for Protein: D4PHA7

Wscd2, WSC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wscd2D4PHA7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Wscd2D4PHA7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Wscd2D4PHA7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Wscd2D4PHA7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Wscd2D4PHA7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Wscd2D4PHA7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Wscd2D4PHA7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Wscd2D4PHA7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Wscd2D4PHA7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Wscd2D4PHA7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Wscd2D4PHA7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Wscd2D4PHA7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Wscd2D4PHA7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Wscd2D4PHA7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Wscd2D4PHA7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Wscd2D4PHA7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Wscd2D4PHA7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Wscd2D4PHA7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Wscd2D4PHA7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Wscd2D4PHA7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Wscd2D4PHA7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Wscd2D4PHA7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Wscd2D4PHA7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Wscd2D4PHA7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Wscd2D4PHA7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Wscd2D4PHA7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Wscd2D4PHA7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Wscd2D4PHA7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Wscd2D4PHA7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Wscd2D4PHA7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Wscd2D4PHA7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Wscd2D4PHA7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Wscd2D4PHA7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Wscd2D4PHA7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Wscd2D4PHA7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Wscd2D4PHA7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Wscd2D4PHA7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Wscd2D4PHA7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Wscd2D4PHA7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Wscd2D4PHA7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Wscd2D4PHA7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Wscd2D4PHA7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Wscd2D4PHA7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Wscd2D4PHA7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Wscd2D4PHA7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Wscd2D4PHA7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Wscd2D4PHA7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Wscd2D4PHA7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Wscd2D4PHA7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Wscd2D4PHA7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Wscd2D4PHA7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Wscd2D4PHA7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Wscd2D4PHA7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Wscd2D4PHA7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Wscd2D4PHA7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Wscd2D4PHA7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Wscd2D4PHA7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Wscd2D4PHA7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Wscd2D4PHA7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Wscd2D4PHA7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Wscd2D4PHA7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Wscd2D4PHA7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Wscd2D4PHA7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Wscd2D4PHA7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Wscd2D4PHA7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Wscd2D4PHA7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Wscd2D4PHA7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Wscd2D4PHA7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Wscd2D4PHA7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Wscd2D4PHA7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Wscd2D4PHA7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Wscd2D4PHA7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Wscd2D4PHA7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Wscd2D4PHA7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Wscd2D4PHA7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Wscd2D4PHA7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Wscd2D4PHA7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Wscd2D4PHA7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Wscd2D4PHA7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Wscd2D4PHA7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Wscd2D4PHA7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Wscd2D4PHA7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Wscd2D4PHA7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Wscd2D4PHA7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Wscd2D4PHA7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Wscd2D4PHA7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Wscd2D4PHA7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Wscd2D4PHA7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Wscd2D4PHA7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Wscd2D4PHA7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Wscd2D4PHA7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Wscd2D4PHA7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Wscd2D4PHA7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Wscd2D4PHA7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Wscd2D4PHA7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Wscd2D4PHA7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Wscd2D4PHA7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Wscd2D4PHA7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Wscd2D4PHA7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Wscd2D4PHA7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms