Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rdh8D3Z6W3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rdh8D3Z6W3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rdh8D3Z6W3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rdh8D3Z6W3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rdh8D3Z6W3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rdh8D3Z6W3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rdh8D3Z6W3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rdh8D3Z6W3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rdh8D3Z6W3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rdh8D3Z6W3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rdh8D3Z6W3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rdh8D3Z6W3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rdh8D3Z6W3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rdh8D3Z6W3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rdh8D3Z6W3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rdh8D3Z6W3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rdh8D3Z6W3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rdh8D3Z6W3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rdh8D3Z6W3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rdh8D3Z6W3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rdh8D3Z6W3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rdh8D3Z6W3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rdh8D3Z6W3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rdh8D3Z6W3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rdh8D3Z6W3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rdh8D3Z6W3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rdh8D3Z6W3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rdh8D3Z6W3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rdh8D3Z6W3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rdh8D3Z6W3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rdh8D3Z6W3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rdh8D3Z6W3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rdh8D3Z6W3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rdh8D3Z6W3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rdh8D3Z6W3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rdh8D3Z6W3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Rdh8D3Z6W3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rdh8D3Z6W3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rdh8D3Z6W3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rdh8D3Z6W3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rdh8D3Z6W3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rdh8D3Z6W3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rdh8D3Z6W3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rdh8D3Z6W3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Rdh8D3Z6W3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rdh8D3Z6W3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rdh8D3Z6W3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rdh8D3Z6W3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rdh8D3Z6W3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rdh8D3Z6W3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rdh8D3Z6W3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rdh8D3Z6W3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rdh8D3Z6W3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rdh8D3Z6W3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rdh8D3Z6W3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rdh8D3Z6W3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rdh8D3Z6W3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rdh8D3Z6W3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rdh8D3Z6W3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rdh8D3Z6W3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rdh8D3Z6W3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rdh8D3Z6W3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rdh8D3Z6W3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rdh8D3Z6W3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rdh8D3Z6W3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rdh8D3Z6W3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rdh8D3Z6W3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rdh8D3Z6W3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rdh8D3Z6W3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rdh8D3Z6W3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rdh8D3Z6W3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rdh8D3Z6W3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rdh8D3Z6W3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rdh8D3Z6W3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rdh8D3Z6W3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rdh8D3Z6W3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rdh8D3Z6W3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rdh8D3Z6W3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rdh8D3Z6W3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rdh8D3Z6W3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rdh8D3Z6W3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rdh8D3Z6W3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rdh8D3Z6W3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rdh8D3Z6W3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rdh8D3Z6W3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rdh8D3Z6W3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rdh8D3Z6W3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rdh8D3Z6W3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rdh8D3Z6W3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rdh8D3Z6W3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rdh8D3Z6W3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rdh8D3Z6W3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rdh8D3Z6W3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rdh8D3Z6W3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rdh8D3Z6W3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rdh8D3Z6W3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rdh8D3Z6W3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Rdh8D3Z6W3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rdh8D3Z6W3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms