Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0P8

Tmem200b, Transmembrane protein 200B, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200bD3Z0P8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem200bD3Z0P8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem200bD3Z0P8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem200bD3Z0P8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem200bD3Z0P8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem200bD3Z0P8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem200bD3Z0P8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem200bD3Z0P8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem200bD3Z0P8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem200bD3Z0P8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmem200bD3Z0P8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmem200bD3Z0P8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmem200bD3Z0P8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmem200bD3Z0P8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmem200bD3Z0P8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmem200bD3Z0P8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmem200bD3Z0P8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmem200bD3Z0P8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmem200bD3Z0P8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmem200bD3Z0P8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmem200bD3Z0P8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmem200bD3Z0P8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmem200bD3Z0P8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmem200bD3Z0P8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmem200bD3Z0P8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmem200bD3Z0P8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem200bD3Z0P8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem200bD3Z0P8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem200bD3Z0P8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem200bD3Z0P8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem200bD3Z0P8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem200bD3Z0P8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem200bD3Z0P8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem200bD3Z0P8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem200bD3Z0P8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem200bD3Z0P8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem200bD3Z0P8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem200bD3Z0P8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem200bD3Z0P8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem200bD3Z0P8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem200bD3Z0P8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem200bD3Z0P8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem200bD3Z0P8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem200bD3Z0P8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem200bD3Z0P8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem200bD3Z0P8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem200bD3Z0P8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem200bD3Z0P8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem200bD3Z0P8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem200bD3Z0P8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem200bD3Z0P8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem200bD3Z0P8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem200bD3Z0P8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem200bD3Z0P8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem200bD3Z0P8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem200bD3Z0P8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem200bD3Z0P8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem200bD3Z0P8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem200bD3Z0P8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem200bD3Z0P8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem200bD3Z0P8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem200bD3Z0P8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem200bD3Z0P8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmem200bD3Z0P8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmem200bD3Z0P8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmem200bD3Z0P8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem200bD3Z0P8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem200bD3Z0P8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem200bD3Z0P8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem200bD3Z0P8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem200bD3Z0P8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem200bD3Z0P8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem200bD3Z0P8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem200bD3Z0P8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem200bD3Z0P8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmem200bD3Z0P8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmem200bD3Z0P8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmem200bD3Z0P8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmem200bD3Z0P8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmem200bD3Z0P8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmem200bD3Z0P8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmem200bD3Z0P8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmem200bD3Z0P8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmem200bD3Z0P8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmem200bD3Z0P8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmem200bD3Z0P8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmem200bD3Z0P8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmem200bD3Z0P8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmem200bD3Z0P8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmem200bD3Z0P8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmem200bD3Z0P8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmem200bD3Z0P8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmem200bD3Z0P8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmem200bD3Z0P8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmem200bD3Z0P8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmem200bD3Z0P8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmem200bD3Z0P8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmem200bD3Z0P8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmem200bD3Z0P8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Tmem200bD3Z0P8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms