Protein–RNA interactions for Protein: B8QI36

Ppfia4, Liprin-alpha 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia4B8QI36 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ppfia4B8QI36 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ppfia4B8QI36 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Ppfia4B8QI36 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ppfia4B8QI36 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ppfia4B8QI36 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ppfia4B8QI36 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ppfia4B8QI36 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ppfia4B8QI36 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ppfia4B8QI36 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ppfia4B8QI36 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ppfia4B8QI36 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ppfia4B8QI36 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Ppfia4B8QI36 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ppfia4B8QI36 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ppfia4B8QI36 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ppfia4B8QI36 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ppfia4B8QI36 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ppfia4B8QI36 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ppfia4B8QI36 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Ppfia4B8QI36 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Ppfia4B8QI36 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ppfia4B8QI36 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ppfia4B8QI36 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ppfia4B8QI36 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ppfia4B8QI36 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ppfia4B8QI36 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ppfia4B8QI36 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ppfia4B8QI36 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ppfia4B8QI36 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ppfia4B8QI36 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Ppfia4B8QI36 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ppfia4B8QI36 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ppfia4B8QI36 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ppfia4B8QI36 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ppfia4B8QI36 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ppfia4B8QI36 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ppfia4B8QI36 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ppfia4B8QI36 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ppfia4B8QI36 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ppfia4B8QI36 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ppfia4B8QI36 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ppfia4B8QI36 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ppfia4B8QI36 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ppfia4B8QI36 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ppfia4B8QI36 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ppfia4B8QI36 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Ppfia4B8QI36 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ppfia4B8QI36 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ppfia4B8QI36 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ppfia4B8QI36 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ppfia4B8QI36 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ppfia4B8QI36 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ppfia4B8QI36 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ppfia4B8QI36 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ppfia4B8QI36 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ppfia4B8QI36 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ppfia4B8QI36 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ppfia4B8QI36 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Ppfia4B8QI36 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ppfia4B8QI36 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ppfia4B8QI36 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ppfia4B8QI36 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ppfia4B8QI36 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ppfia4B8QI36 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ppfia4B8QI36 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Ppfia4B8QI36 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ppfia4B8QI36 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ppfia4B8QI36 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ppfia4B8QI36 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ppfia4B8QI36 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Ppfia4B8QI36 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ppfia4B8QI36 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ppfia4B8QI36 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ppfia4B8QI36 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ppfia4B8QI36 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ppfia4B8QI36 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ppfia4B8QI36 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ppfia4B8QI36 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ppfia4B8QI36 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ppfia4B8QI36 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ppfia4B8QI36 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ppfia4B8QI36 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ppfia4B8QI36 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ppfia4B8QI36 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ppfia4B8QI36 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ppfia4B8QI36 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ppfia4B8QI36 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ppfia4B8QI36 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ppfia4B8QI36 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ppfia4B8QI36 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ppfia4B8QI36 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Ppfia4B8QI36 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Ppfia4B8QI36 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ppfia4B8QI36 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ppfia4B8QI36 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ppfia4B8QI36 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ppfia4B8QI36 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ppfia4B8QI36 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Ppfia4B8QI36 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 157.9 ms