Protein–RNA interactions for Protein: B8QI36

Ppfia4, Liprin-alpha 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia4B8QI36 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Ppfia4B8QI36 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,15
Ppfia4B8QI36 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28,45■■■□□ 2,14
Ppfia4B8QI36 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Ppfia4B8QI36 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Ppfia4B8QI36 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Ppfia4B8QI36 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,13
Ppfia4B8QI36 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28,38■■■□□ 2,13
Ppfia4B8QI36 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Ppfia4B8QI36 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,37■■■□□ 2,13
Ppfia4B8QI36 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Ppfia4B8QI36 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Ppfia4B8QI36 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28,33■■■□□ 2,13
Ppfia4B8QI36 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Ppfia4B8QI36 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Ppfia4B8QI36 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Ppfia4B8QI36 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Ppfia4B8QI36 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,29■■■□□ 2,12
Ppfia4B8QI36 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,28■■■□□ 2,12
Ppfia4B8QI36 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28,28■■■□□ 2,12
Ppfia4B8QI36 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28,28■■■□□ 2,12
Ppfia4B8QI36 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Ppfia4B8QI36 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Ppfia4B8QI36 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,12
Ppfia4B8QI36 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28,25■■■□□ 2,11
Ppfia4B8QI36 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28,23■■■□□ 2,11
Ppfia4B8QI36 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Ppfia4B8QI36 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Ppfia4B8QI36 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28,21■■■□□ 2,11
Ppfia4B8QI36 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28,21■■■□□ 2,11
Ppfia4B8QI36 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28,19■■■□□ 2,1
Ppfia4B8QI36 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Ppfia4B8QI36 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Ppfia4B8QI36 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Ppfia4B8QI36 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Ppfia4B8QI36 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Ppfia4B8QI36 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Ppfia4B8QI36 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,1■■■□□ 2,09
Ppfia4B8QI36 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Ppfia4B8QI36 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,07■■■□□ 2,08
Ppfia4B8QI36 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Ppfia4B8QI36 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Ppfia4B8QI36 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Ppfia4B8QI36 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Ppfia4B8QI36 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28,03■■■□□ 2,08
Ppfia4B8QI36 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28,03■■■□□ 2,08
Ppfia4B8QI36 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,08
Ppfia4B8QI36 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Ppfia4B8QI36 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Ppfia4B8QI36 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27,99■■■□□ 2,07
Ppfia4B8QI36 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27,99■■■□□ 2,07
Ppfia4B8QI36 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Ppfia4B8QI36 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27,98■■■□□ 2,07
Ppfia4B8QI36 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27,97■■■□□ 2,07
Ppfia4B8QI36 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Ppfia4B8QI36 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Ppfia4B8QI36 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Ppfia4B8QI36 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Ppfia4B8QI36 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27,91■■■□□ 2,06
Ppfia4B8QI36 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Ppfia4B8QI36 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Ppfia4B8QI36 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27,89■■■□□ 2,06
Ppfia4B8QI36 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27,87■■■□□ 2,05
Ppfia4B8QI36 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27,86■■■□□ 2,05
Ppfia4B8QI36 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Ppfia4B8QI36 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27,84■■■□□ 2,05
Ppfia4B8QI36 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Ppfia4B8QI36 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Ppfia4B8QI36 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Ppfia4B8QI36 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Ppfia4B8QI36 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27,77■■■□□ 2,04
Ppfia4B8QI36 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Ppfia4B8QI36 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27,75■■■□□ 2,03
Ppfia4B8QI36 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Ppfia4B8QI36 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Ppfia4B8QI36 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Ppfia4B8QI36 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,03
Ppfia4B8QI36 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Ppfia4B8QI36 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Ppfia4B8QI36 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,67■■■□□ 2,02
Ppfia4B8QI36 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Ppfia4B8QI36 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27,65■■■□□ 2,02
Ppfia4B8QI36 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,63■■■□□ 2,01
Ppfia4B8QI36 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27,62■■■□□ 2,01
Ppfia4B8QI36 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Ppfia4B8QI36 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27,61■■■□□ 2,01
Ppfia4B8QI36 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Ppfia4B8QI36 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Ppfia4B8QI36 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Ppfia4B8QI36 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Ppfia4B8QI36 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27,57■■■□□ 2
Ppfia4B8QI36 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27,57■■■□□ 2
Ppfia4B8QI36 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27,56■■■□□ 2
Ppfia4B8QI36 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Ppfia4B8QI36 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,55■■■□□ 2
Ppfia4B8QI36 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Ppfia4B8QI36 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Ppfia4B8QI36 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Ppfia4B8QI36 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,53■■■□□ 2
Ppfia4B8QI36 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31,7 ms